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数据批量从nii格式转成npz格式

npy格式：数组是以未压缩的原始二进制格式保存在扩展名为.npy的文件中。

npz 格式：数组是以压缩的原始二进制格式保存在扩展名为.npy的文件中。

以下代码展示了如何批量处理nii 转化成npz 数据

import osimport numpy as np
import SimpleITK as sitkNII_DIR = 'D:/MRIRegistration/Data/'def get_filelist(dir, Filelist):if os.path.isdir(dir):for s in os.listdir(dir):newDir = os.path.join(dir, s)Filelist.append(newDir)return Filelistlist = get_filelist(NII_DIR, [])
print(len(list))for e in list:Refimg = sitk.ReadImage(e)RefimgArray = sitk.GetArrayFromImage(Refimg)fileName = e.split('\\')[-1]fileName = fileName.replace('nii','npz')outPutDir = 'D:/voxelmorph-master/DataMask/atlas_norm.npz'np.savez(outPutDir, vol_data=RefimgArray)

 

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