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2024年3月19日发(作者：给了api接口 怎么使用)
一口气安装800个R包
我们周末班准备工作主要就是希望大家学
会安装R包 /
首先配置中国大陆特色镜像
如果是在海外网络，通常是不需要选择我们这里的代码里面的清
华大学和中科院镜像：
options()$repos
options()$BioC_mirror
options(BioC_mirror="/bioc/")
options("repos" = c(CRAN="/CRAN/"))
options()$repos
options()$BioC_mirror
然后按需安装指定的R包
一般来说，我们做生物信息，下面的包肯定是必不可少。但是需
要一个个包去记录，去慢慢安装：
# /packages/release/bioc/html/
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
es("BiocManager")
BiocManager::install("",ask = F,update = F)
BiocManager::install(c("GSEABase","GSVA","clusterProfiler" ),
ask = F,update = F)
BiocManager::install(c("GEOquery","limma","impute" ),ask =
F,update = F)
BiocManager::install(c("","" ),as
k = F,update = F)
实际上，大家即使是没有学习过R包安装，也可以看得懂，变化
R包名字，就可以一行行运行代码来安装指定的包了！
批量安装R包而且不重复安装呢？
当然也是有办法的， 我在移植一些shiny应用程序就用到过：
es <- c("shiny",
"tidyr",
'tidyverse',
"clusterProfiler",
"DT",
"ashr",
"enrichplot",
"plotly")
# 这个 es 变量可以是读取一个包名字文件，比如文
末的800多个包：
all_packages = rownames(es())
save(all_packages,file = 'all_')
#checking missing packages from list
es <- es[!(es %in% inst
es()[,"Package"])]
es
packToInst <- setdiff(es, es())
packToInst
if(T){
lapply(packToInst, function(x){
BiocManager::install(x,ask = F,update = F)
})
}
lapply(intersect(packagesReq, es()),function(
x){
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