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2024年4月15日发(作者:有netty还需要tomcat吗)

二代宏基因组测序数据标准分析流程

1范围

本标准规定了二代宏基因组测序数据标准分析流程的操作规范。

本标准适用于近年来非常关注微生物组学的研究以及基于二代宏基因组测

序数据的标准分析流程。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期

的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改

单)适用于本文件。

GB/T29859

GB/T34798

生物信息学术语

核酸数据库序列格式规范

3术语和定义

3.1

测序sequencing

测定氨基酸或者核苷酸序列的过程

3.2

核酸序列nucleicacidsequence

核酸分子中的(脱氧)核苷酸的排列顺序,常用

IPUAC

的核苷酸字符集进

行描述。

3.3

序列比对

sequencealignment

比较两个或两个以上核苷酸或者氨基酸序列间的相似性过程。

3.4

序列相似性sequencesimilarity

序列比对过程中,用来描述检测序列和目标序列之间相同脱氧核糖核酸碱基

或氨基酸残基序列所占比例高低的性质。

3.5

基本局部搜索工具

basiclocalalignmentsearchtool;BLAST

基于局部比对的序列数据库搜索工具


本文标签: 序列 文件 核苷酸 标准