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2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
J
ournal
of
MuDanJiang
Medical
U
niversity
Feb.
2021
第
42
卷第
1
期
Vol.
42
No.
1
2021
・
43
・
肺腺癌差异基因的生物信息学研究
兰宏伟
-
马微
2
,
李娜
3
,
赵若啥
4
(
牡丹江医学院
1
•
附属红旗医院肿瘤科
;
2
•
研究生处
；
3
•
附属红旗医院内分泌科
；
4.
科研处
，
黑龙江
牡丹江
157011)
摘要
：
目的
通过生物信息学筛选出肺腺癌中的差异基因
,
为肺腺癌分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据
。
方法
从
GEO
数据库中选择编号为
GSE118370
及
GSE116959
的基因芯片
，
在
TCGA
数据库中选择肺腺癌的转录组数据
，
分别
通过
R
语言下载
、
整理并筛选出差异表达基因
(
Differentially
expressed
genes,DEG)
。
通过在线工具
STRING
得到
DEG
的蛋白
互作
(
Protein-protein
interation,PPI)
网络
，
利用
Cytoscape
软件得到枢纽基因
(
hub
基因
)
；
Oncomine
数据库分析
hub
基因在肿
瘤中的总体表达情况
,
GEPIA
数据库验证
hub
基因在肺腺癌中的表达
。
cBioPortal
数据库分析
hub
基因在结肠癌中的突变情
况
,
Kaplan-Meier
Plotter
数据分析
hub
基因与肺腺癌预后之间的关系
。
结果
通过
3
个数据集取交集后共筛选出肺腺癌
DEG
185
个
,
其中表达下调
DEG
有
152
个
，
表达上调
DEG
有
33
个
。
通过
STRING
、
Cytoscape
得到了
DEG
的
PPI
网络并筛选出了
hub
基因
，
通过对排名靠前的血小板和内皮细胞粘附分子
l(Platelet
And
Endothelial
Cell
Adhesion
Molecule
1,
PECAM1)
、
血管
性血友病因子
(
Von
Willebrand
Factor,
VWF
)
、
小凹蛋白
1
(
Caveolin
1,
CAV1
)
及
TEK
受体酪氨酸激酶
(
TEK
Receptor
Tyrosine
Kinase,TEK)4
个
hub
基因的进一步分析
，
最终验证了
PECAM1
等
4
个基因在肺腺癌中低表达
,
且发现
PECAM1
等
4
个基因在
肺腺癌中突变率较低
，
并与肺腺癌患者预后密切相关
。
结论
本研究通过生物信息学分析得到了肺腺癌的差异基因
，
并认为
PECAM1
、
VWF
、
CAV1
、
TEK
可能作为评估肺腺癌预后的生物标志物
。
关键词
：
肺腺癌
;
生物信息学
;
差异基因
;
GEO
；
TCGA
中图分类号：
R734.2
文献标识码
：
A
文章编号
：
1001-7550
(
2021
)
01-0043-07
Bioinformatics
study
of
differentially
expressed
genes
in
lung
adenocarcinoma
LAN
Hong-wei
et
al
(
Department
of
oncology
,
Hongqi
Hospital
Affiliated
to
Mudanjiang
Medical
University
,
Mudanjiang
157011
,
China
)
Abstract
:
Objective
To
screen
differentially
expressed
genes
(
DEGs)
in
lung
adenocarcinoma
through
bioinformatics,so
as
to
provide
a
theoretical
basis
for
molecular
biological
research
and
biomarker
screening
of
lung
adenocarcinoma.
Methods
The
gene
chips
numbered
GSE118370
and
GSE116959
were
selected
from
the
GEO
database
,
and
the
transcriptome
data
of lung
adenocarcinoma
were
selected
from
the
TCGA
were
downloaded,sorted,and
screened
through
the
R
DEGs
protein-protein
inter
action
network
(
PPI)
was
obtained
from
the
STRING
online
tool,and
the
hub
gene
was
obtained
using
Cytoscape
software.
The
Oncom-
ine
database
was
used
to
analyze
the
overall
expression
of
the
hub
gene
in
the
tumor,and
the
GEPIA
database
was
used
to
verify
the
hub
gene
expression
in
lung
adenocarcinoma.
The
cBioPortal
database
analyzed
the
mutations
of
the
hub
gene
in
colon
cancer,and
finally
an
alyzed
the
relationship
between
the
hub
gene
and
the
prognosis
of
lung
adenocarcinoma
through
Kaplan
一
Meier
Plotter
data.
Results
A
total
of
185
lung
adenocarcinoma
DEGs
were
screened
through
the
intersection
of
the
three
data
sets
,
of
which
152
were
down-regula
ted
DEGs
and
33
were
h
STRING
and
Cytoscape,we
obtained
DEGs'
PPI
network
and
selected
the
hub
facilitate
subsequent
analysis,we
selected
the
top
4
hub
genes
:
Platelet
and
Endothelial
Cell
Adhesion
Molecule
1
(
PECAM1
)
,
Von
Willebrand
Factor
(
VWF)
,
Caveolin
1
(
CAV1
)
and
TEK
Receptor
Tyrosine
Kinase
(
TEK)
for
further
analysis
,
and
finally
verified
PECAM1
and
other
4
genes
which
lowly
expressed
in
lung
rmore,we
found
that
PECAM1
and
the
other
3
genes
have
a
low
mutation
rate
in
lung
adenocarcinoma
,
and
are
closely
related
to
the
prognosis
of
lung
adenocarcinoma
patients.
Conclusion
In
this
study
,
DEGs
in
lung
adenocarcinoma
were
obtained
through
bioinformatics
analysis
,
it
is
also
believed
that
PECAM1
,
VWF,
CAV1
,
and
TEK
may
be
used
as
prognostic
organisms
for
evaluating
lung
adenocarcinoma
biological
marker.
Key
words
:
Lung
adenocarcinoma
；
Bioinformatics
；
differentially
expressed
genes
；
GEO;TCGA
基金项目
：
牡丹江医学院研究生创新科研项目(
2019YJSCX-03MY
)
；
黑龙江省高等学校基本科研业务费科研项目
(
2019-KYYWFMY-0026
)
；
黑龙江省高等学校基本科研业务费科研项目
(
2019-KYYWFMY-0063
)
；
黑龙江省教育厅攀登计划项目
(
2018-KYYWFMY-0009
)
作者简介
：
兰宏伟
(
1993-),
男
，
硕士研究生
，
研究方向
：
消化道肿瘤的诊疗
。
通讯作者
：
马微
，
：
maweituteng@
。
2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
J
ournal
of
MuDanJiang
Medical
U
niversity
Feb.
2021
・
44
・
第
42
卷第
1
期
Vol.
42
No.
1
2021
肺癌是对人类健康威胁最大的恶性肿瘤
,
根据
生存率依然很低
［
3
］
。
在此背景下
，
本文拟通过生物
信息学分析寻找肺腺癌中的差异表达基因，
以期为
2018
年发布的最新癌症统计数据
，
肺癌是全世界最
常见的癌症类型
(
约占所有癌症的
11.6%),
也是癌
肺腺癌的发生发展机制
、
临床诊疗及靶向药物的研
制提供一定理论依据
。
症死亡的首要原因
(
占癌症死亡总数的
18.4%)
［
1
］
,
非小细胞肺癌约占肺癌的
85%
以上
,
而肺腺癌则是
非小细胞肺癌的主要分型
,
据统计
,
肺腺癌占所有肺
1
资料与方法
1.1
数据资料
GEO
(
Gene
Expression
Omnibus
)
数
癌病例的
40%
左右
［
2
］
。
而肺腺癌早期临床症状缺
乏
、
容易发生远处转移及耐药率高的特点
，
给临床治
据库
(
http
:
//
www
.
ncbi.
.
gov/geo
)
是当前最大
的基因芯片数据库之一
，
包括
1
万多个基因表达谱
疗带来了极大挑战
。
随着分子生物的发展
，
越来越
多医学研究集中在肿瘤的分子及基因层面
，
靶向药
物的研发与使用则为肿瘤治疗带来了新的希望
，
而
寻找与肿瘤发生发展密切相关的差异基因是靶向药
物研制的重要基础
。
近年来
，
在肺腺癌的发病机制
芯片
，
涉及
300
多万个样本
，
基本覆盖了所有肿瘤的
基因表达数据
。
本研究从
GEO
数据库中筛选了编
号为
GSE118370、
GSE116959
的基因芯片
，
并从
TC-
GA
(
The
Cancer
Genome
Atlas)
数据库
(
https
：
//por-
/)
选取了肺腺癌的转录组数据进
研究和治疗新方法方面取得了一定成就
，
但肺腺癌
仍然是最具侵袭性和致命性的肿瘤类型之一
,5
年
行分析
。
见表
1
。
表
1
选取数据资料的一般情况
作者
Rezzonico
R
[4]
2019
芯片序列号
GSE116959
GSE118370
组织来源
肺
肺
肺
芯片平台编号
GPL17077
正常样本
11
6
肿瘤样本
57
6
Xu
L
⑸
2019
TCGA
GPL570
--
59535
1.2
1.2.1
方法
下载数据及预处理
通过
R
语言
(Rx
64
过
STRING
获得
DEG
的
PPI
网络
，
将
PPI
网络导入
Cytoscape
软件
(
3.8.0
版本
)
进行可视化分析
，
并利
4.02
版本
)
的
GEOquery
R
包下载
GSE118370
、
GSE116959
基因芯片及相应的注释文件
，
并通过
limma
R
包对数据进行整理
、
规范化
、
数据合并及注
用插件
cytoHubba
筛选出排名靠前的
hub
基因进一
步分析
。
1.2.4
验证
hub
基因
Oncomine
数据库
(
http
：
//
释转换
。
利用
TCGAbiolinks
R
包
，
下载
TCGA
数据
库中肺腺癌的转录组数据
,
并通过
NCBI
获得人类
基因组注释
GTF
文件后
，
进行注释转换
。
)
是一种癌症微阵列数据库和基于
Web
的数据挖掘平台
，
旨在激发全基因组表达分析
1.2.2
筛选差异基因
针对
GSE118370
、
GSE116959
的新发现
，
并比较大多数主要类型癌症与各自正常
组织中的转录组数据
［
7
］
。
GEPIA
(
gene
expression
profiling
interactive
analysis
)
在线数据库
(
http
：
//ge-
芯片数据集
,
通过
limma
R
分别筛选差异基因
DEG,
筛选条件为
:
表达变化倍数大于
2(
I
log2FC
1>1),
同
时修正后
P
值小于
0.05
。
针对
TCGA
的肺腺癌数据
,
/)
涵盖了源自于
TCGA
数据库及
GTEx(
the
genotype-tissue
expression
)
数据
库的肿瘤资料
,
基本包含了常见肿瘤组织及相应正
常组织的表达数据⑻
。
通过
Oncomine
数据库
，
分析
利用
DESeq2
R
包筛选
DEG,
设置筛选条件为
I
log2FC
I
>2,
同时修正后
P
值小于
0.05
。
将获得的
DEG
分别
导入在线软件
draw
Venn
diagrams
(
http
:/
/bioini'orma-
/webtools/Venn/)
，
获得
3
个数据集
选取的
hub
基因在常见肿瘤中的总体表达趋势
，
并
通过
GEPIA
验证
hub
基因在肺腺癌中的表达情况
。
1.2.5
分析
hub
基因的突变情况
cBioPortal
(
The
取交集后的重叠
DEG
及韦恩图
。
1.2.3
差异表达基因蛋白质互建网络分析
cbio
cancer
genomics
portal
)
数据库
(https
：
//www.
STRING
(
search
tool
for
the
retrieval
of
interacting
genes
)
是一种在线工具
(
/)
,
旨
^
)
主要用于探索
、
可视化和分析多维度
癌症基因组数据,使研究者可以交互探索不同样本
、
在评估和整合蛋白质
-
蛋白质相互作用信息
，
例如
基因
、
通路的遗传学上的改变,并可以与临床数据相
结合⑼
。
通过
cBioPortal
选择肺腺癌的数据集
，
分
物理和功能关联
，
迄今为止
’
STRING
11.0
版涵盖了
来自
2,031
个生物体的
9,643,763个蛋白质⑷
。通
析
hub
基因在肺腺癌中的突变情况
，
以此分析
hub
2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
Journal
of
MuDanJiang
Medical
University
Feb.
2021
Vol.
42
No.
1
第
42
卷第
1
期
2021
・
45
・
基因在肺腺癌中的表达变化是自身发生突变所致还
中表达下调
DEG
1512
个
，
表达上调
DEG
730
个
；
TCGA
的肺腺癌数据共筛选出
DEG
2241
个
,
其中表
是其他因素影响的结果
。
1.2.6
分析
hub
基因与肺腺癌预后的关系
Kaplan
-Meier
Plotter
数据库
(
http
:
///analysis/
)
达下调
DEG
569
个
，
表达上调
DEG
1672
个
。
将
3
个数据集的差异基因取交集后共得到
185
个重叠的
是一个包含基因表达数据和临床数据的在线数据
DEG(
图
1),
其中表达下调
DEG
152
个
，
表达上调
DEG
33
个
。
表
2
选取了上调及下调
Top10
的
DEG
库
，
覆盖了肺癌
、
卵巢癌
、
胃癌和乳腺癌等肿瘤的基
因及临床数据
[10]
o
为了进一步分析
hub
基因的潜
在作用
，
我们通过
Kaplan-Meier
Plotter
数据库分析
的表达情况进行展示
,
图
2
为所有重叠
DEG
在
3
个
了
hub
基因与肺腺癌的总生存率
(
Overall
survival
,
OS)
之间的关系
，
以此探讨
hub
基因对肺癌患者预
后的影响
。
2
结果
2.1
差异基因筛选
获得表达数据后
，
根据筛选标
准
,GSE118370
芯片数据集中共筛选出
DEG
869
个
,
其中表达下调
DEG
647
个
，
表达上调
DEG
222
个
；
GSE116959
基因芯片共筛选出
DEG
2242
个
，
其
表
2
前
10
个共同上调及共同下调差异表达的基因
基因
SPINK1
4.75
3.86
3.26
GSE118370
Log2FC
GSE11699
TCGA
adj
.
P
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
<
0.05
Log2FC
adj.
P
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
Log2FC
6.66
4.92
adj
.
P
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
<
0.001
4.81
3.53
2.02
上调
上调
上调
上调
上调
上调
上调
上调
上调
上调
下调
下调
下调
下调
下调
下调
下调
下调
下调
下调
MMP1
FAM83A
6.78
4.83
TMPRSS4
GJB2
3.90
3.06
3.16
2.55
2.71
2.94
1.89
4.54
3.68
3.48
HS6ST2
CP
4.16
2.23
COL10A1
2.69
4.61
3.61
IQGAP3
MEX3A
2.51
1.39
2.35
2.74
4.18
-
4.53
-4.5
FAM107A
MYOC
-2.91
-3.24
-3.57
-3.33
-1.42
CD300LG
-4.98
-3.57
-3.18
-4.94
-4.71
SFTPC
CLDN18
-3.31
-5.11
-4.1
-2.66
-3.52
-5.01
AGER
-2.81
-4.82
FABP4
FCN3
-4.88
-4.5
-4.33
-4.35
-4.47
-6.18
-4.13
-4.46
TMEM100
SLC6A4
-2.08
-6.14
2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
Journal
of
MuDanJiang
Medical
University
Feb.
2021
Vol.
42
No.
1
2021
・
46
・
第
42
卷第
1
期
G
S
G
E
S
H
E
S
H
6
7
9
0
5
9
图
2
重叠
DEG
的表达聚类热图
2.2
差异表达基因
PPI
网络分析及
hub
基因的筛
选
为了进一步探索
DEG
之间的关系
，
将最终得到
的
185
个
DEG
导入
STRING
在线工具
，
获得
DEG
的
PPI
网络
，
该网络由
185
个蛋白节点及
220
条边组
成
，
将所得结果导入
Cytoscape
软件
,
选择主要模块
进一步分析
，
该模块包括
127
个蛋白
。
利用插件
cy
toHubba
并按
Degree
计算方法得到最终的
PPI
网络
（
图
3A
）
。
按
Degree
高低排序
,
筛选出排名前
4
的
hub
基因进一步分析
,4
个
hub
基因分别为表达下调
基因
PECAM1
、
VWF
、
CAV1
及
TEK
（
图
3B
）
。
2.3
hul）
基因的验证
基于
Oncomine
数据库分析
4
个
hub
基因在多肿瘤中的表达趋势
，
结果显示
4
个
hub
基因在肿瘤中并不总是低表达
，
如
PECAM1
在脑和中枢神经系统肿瘤
、
胃肠道肿瘤中呈高表达
状态
,CAV1
在头颈部肿瘤
、
白血病
、
肝癌中高表达
,
尽管如此
,hub
基因在肿瘤中总体呈低表达趋势
（
图
4
）
。
通过
GEPIA
在线数据库分析
hub
基因在肺腺
癌种的表达情况
，
结果显示相对于正常组织
,4
个
hub
基因在肺腺癌中明显低表达
（
P
<0.05
）
（
图
5
）
,
符合我们前期的分析结果
，
即
PECAM1
、
VWF
、
CAV1
、
TEK
基因在肺腺癌中表达下调
。
2.4
hub
基因的突变情况分析
通过
cBioPortal
选
取了
5
项肺腺癌数据库
，
分别来自
Marcin
Imielins-
ki
[11]
、
Naiyer
A
Rizvi
[12]
、
Jianbin
Chen
[13]
、
Li
Ding
[14]
等人及
TCGA
数据库
（
图
6
）
，
包括
1272
例肺腺癌患
者
。
结果显示
,PECAM1
等
4
个
hub
基因在肺腺癌
中的表达率均较低
，
突变率最高的为
VWF,
但也仅
有
5%
（
图
6
）
。
图
3
DEG
的
PPI
网络
（
A
）
及
4
个
hub
基因
（
B
）
图
4
hub
基因在肿瘤中的表达情况
2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
Journal
of
MuDanJiang
Medical
University
Feb.
2021
Vol.
42
No.
1
第
42
卷第
1
期
2021
・
47
・
pecaih
*
TEK
CAV1
oe
IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIHIIIH
川
II
川川川
lllllll
川川川
IIIIIIIIH
川川
l
-
llllllllll
川
11111
川
1
川
1
川
111111111
川
111
川
111
川
111111
川川
1111
川
111
川
111111111
川川川卜
t
IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIHIIIIIIIIIII
川
IIIIIIIHI
川川
IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIHIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
川川||||
I
I
IIIIIIIIIIIHIII
川
IIIIIIIIIIIIIII
川川川川
||川|川||||||||||||川||川|
川
||川川|||||川||||||川|川|||||||||||||
|
Missense
Mutation
(unknown
significance)
|
Truncating
Mutation
(unknown
significance)
|
Amplification
|
Deep
Deletion
|
No
alterations
-
Not
profiled
|
Lung
Adenocarcinoma
(Broad,
Cell
2012)
|
Lung
Adenocarcinoma
(MSKCC,
Science 2015)
|
Lung
Adenocarcinoma
(OncoSG,
Nat
Genet
2020)
|
Lung
Adenocarcinoma
(TCGA,
Firehose
Legacy)
|
Lung
Adenocarcinoma
(TSP,
Nature
2008)
G@n@tic
Alteration
Study
of
origin
图
6
hub
基因在肺腺癌中的突变情况
2.5
hu
）
基因与怖腺癌预后的关系
为了进一步
分析
hub
基因与肺腺癌的关系
，
我们通过
Kaplan
-
Meier
plotter
在线数据库分析了
hub
基因与肺腺癌
TEK
均与肺腺癌患者的
OS
密切相关
（
P
<0.05
）
,
且
PECAM1
、
VWF、
CAV1
及
TEK
在肺腺癌中的表达越
高
,
患者预后越好
（
图
7
）
o
3
讨论
腺癌是原发性肺癌最常见的组织学亚型
，
是癌
还发现
4
个
hub
基因在肺腺癌中的突变率均较低
，
这说明
PECAM1
等基因在肺腺癌中的低表达趋势
较稳定
，
且这种表达变化可能不是由于基因自身突
变引起的
。
最后
,
我们通过分析
hub
基因与肺腺癌
症死亡的主要原因
。
本研究通过
GEO
数据库选取
了编号为
GSE118370
、
GSE116959
的基因芯片
，
联合
患者预后之间的关系
，
发现
PECAM1
等基因表达越
TCGA
数据库筛选出了
185
个
DEGo
进一步筛选出
了
hub
基因
，
为了便于分析
，
选取了排序最高的
PE-
CAM1
等
4
个
hub
进行验证及进一步分析
。
通过
咼的患者预后越好
,
这说明
PECAM1
等基因具有一一
定潜力作为监测肺腺癌患者预后的生物标记物
，
并
可能在肺腺癌中发挥抑癌作用
。
PECAM1,
也称为
CD31,
属于免疫球蛋白超家
Oncomine
数据库
，
我们发现
PECAM1
、
VWF
、
CAV1
、
TEK
基因在常见的肿瘤中并不总是低表达
,
针对不
同肿瘤要具体分析
。
在
GEPIA
在线数据库中
，
我们
族
,
参与了原发性肿瘤生长和增殖的多个过程
，
包括
血管生成
，
血管通透性和细胞外循环
［
⑸
。
有证据表
明
,PECAM1
促进多种恶性肿瘤如结直肠癌
、
和急性
进一步证实了
hub
基因在肺腺癌中呈低表达
，
我们
2021
年
02
月
牡丹江医学院学报
J
ournal
of
MuDanJiang
Medical
U
niversity
Feb.
2021
・
48
・
第
42
卷
第
1
期
Vol.
42
No.
1
2021
髓系白血病的发生发展
［'
6
-'
7
］
,PECAM1
还可经由
FAK/Akt
信号通路上调整合素
01
来诱导肝细胞癌
的上皮间质转化
,
从而促进肝癌转移
［
18
］
,
因此
,
PE-
CAM1
在肿瘤中通常被认为是一种促癌基因此外
。
但是这种定义并不准确
,
例如在肾细胞癌中就发现
,
PECAM1
表达越高的患者预后反而越好
［
19
］
。
而在
本研究中也发现
，
PECAM1
在多种肿瘤中低表达
。
VWF
是一种大型多功能糖蛋白
,
在止血方面具重要
功能,
常见的作用是导致动脉粥样硬化、
血栓形成或
其他血液疾病
［
20
］
。
VWF
在肿瘤中研究较少
，
有研
究表明
，
VWF
在肿瘤中主要促使癌症相关的静脉血
栓栓塞症的发生
［
21
］
,VWF
还可能作为早期诊断腺
瘤
、
结肠癌及肝细胞癌的生物标志物
［
20,22
］
。
CAV1
是由
178
个氨基酸组成的一种膜蛋白
，
与细胞的内
吞作用
,
细胞外基质的组织
,
细胞迁移和信号传导有
关
［
23
］
。
CAV1
在癌症中的作用是具有争议性的
，
早
期研究发现
CAV1
在肺癌
、
结直肠癌
、
乳腺癌及卵巢
癌中均表达减少
，
并认为其是一种抑癌因子
，
但是随
着研究的深入
，
发现
CAV1
在肝癌
、
结肠癌
、
乳腺癌
、
肾癌等癌症中也可发挥促癌的作用
［
23-24
］
。
最终认
为
,
CAV1
在癌症中具有双重作用
，
具体发挥什么作
用取决于癌症类型和阶段
，
在同一肿瘤的早期阶段
,
CAV1
的可以是作为一种肿瘤抑制
，
而在后期阶段
,
CAV1
表达则更多的是促进肿瘤进展和转移
［
25
］
。
TEK,
也被称为
Tie-2,
最初被鉴定为血管内皮细胞
特异性受体
，
在正常组织及肿瘤血管生成和重塑的
调节中起重要作用
［
26
］
。
尽管与多种肿瘤关系密切
，
但TEK
在肿瘤中的具体作用及作用机制并不清晰
。
TEK
能增强星形胶质瘤的侵袭特性
［
27］
，
与乳腺癌的
早期局部复发有关
［
28
］
,
且是透明细胞肾细胞癌的的
潜在生物标志物
［
29
］
,
而同时
，
在膀胱癌患者样品中
则发现
TEK
水平明显降低
［
30
］
，
在肺鳞癌中
，
TEK
的
表达也呈低表达状态
［
31
］
。
因此
,
TEK
在肿瘤中也可
能具有双重作用
，
但这需要更多的实验来证明
。
总之
，
我们通过本研究筛选出了肺腺癌中的差
异基因
，
并通过选取
PECAM1
等
4
个基因进一步分
析
，
最终证明了
PECAM1
等
4
个基因具有潜力用来
评估肺腺癌的预后,
并可能发挥抑癌作用
。
特异性
基因或生物标志物的筛选对肺腺癌的诊断
、
病情评
估
、
个体化治疗及靶向药物均具有重要意义
，
但同
时
，
通过生物信息学筛选出差异基因也只是肺腺癌
分子生物研究的起始基础阶段
，
要了解差异基因具
体作用及作用机制
,
还需要基础实验的验证
,
以及基
因变异等情况的深入分析
。
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02
月
牡丹江医学院学报
J
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Feb.
2021
第
42
卷
第
1
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42
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(
收稿日期
：
2020-06-30
本文编辑
：
付
微
)
(
上接
37
页
)
[4]
王怀洲
，
石砚
，
洪洁
，
等
•
小梁消融术治疗开角型青光眼的初步结
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K
ctive
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Modified
(
收稿日期
：
2020-08-01
本文编辑
：
付
微
)
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