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2024年5月1日发(作者:表格怎么做乘法公式)
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生物信息学资料
生物信息学
绪论
通过国际合作,用15年时间(1990~2005)至少投入30亿美元,构建详细的人类基因组遗传
图和物理图 ,确定人类DNA的全部核苷酸序列,定位约2.5万基因,并对其它生物进行类
似研究。
2.我国自主产权的全基因组测序计划
水稻 (2002)家鸡 (2004)家蚕 (2004)家猪 (2012)大熊猫 (2009)
3.生物信息学的概念
采用信息科学技术,借助数学、生物学的理论、方法,对各种生物信息(包括核酸、蛋白质
等)的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。
收集、加工、储存:计算机科学家
分析、解释:生物学家
4.生物信息学的发展历史
20世纪50年代,生物信息学开始孕育
20世纪60年代,生物分子信息在概念上将计算
生物学和计算机科学联系起来
20世纪70年代,生物信息学的真正开端(序列比对算法)
20世纪80年代初期,生物信息分析方法的发展
20世纪80年代以后,生物信息服务机构和数据库
20世纪90年代后 ,HGP促进生物信息学的迅速发展
1956: 美国田纳西州首次召开了“生物学中的理论研讨会”;
1962: Zucherkandl和Pauling研究了序列变化与进化的关系,开创了一个新的领域——分子进
化;
1967: Dayhoff研制出蛋白质序列图集,即后来著名的蛋白质信息源PIR;
1970: Needleman和Wunsch提出了著名的序列比对算法,是生物信息学发展中最重要的贡
献;
1970: Gibbs和McIntyre发表著名的矩阵打点做图法;
1978: Gingeras等人研制了核酸序列中酶切位点识别程序;
1981: Smith和Waterman提出了著名的公共子序列识别算法,同年Doolittle提出了关于序列
模式的概念;
1982: GenBank第3版本正式发行;
1983: Wilbur和Lipman发表了数据库相似序列搜索算法;
1986: 日本核酸序列数据库DDBJ诞生;
1986: 蛋白质数据库SWISS-PROT诞生;
1988: 美国国家生物技术信息中心NCBI诞生;
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1988: 成立欧洲分子生物学网络(EMBNet),EMBL数据库诞生;
1988: Person和Lipman发表了著名的序列比较算法FASTA;
1990: 快速相似性序列搜索算法BLAST问世,1987年BLAST的改进版本PSI-BLAST投入使用
1996: Affymetrix生产出第1块DNA芯片。
5.生物信息学主要研究内容
1) 生物分子数据的收集与管理
2) 数据库搜索及序列比较
3) 基因组序列分析
4) 基因表达数据的分析与处理
5) 蛋白质结构预测
6.生物信息学概念
广义:
概念(狭义):
生物分子信息的获取、存贮、分析和利用
7. 生物信息学主要研究两种信息载体
核酸分子
蛋白质分子
8.生物分子数据及其关系
8.第一部遗传密码已被破译,但对密码的转录过程还不清楚,对大多数DNA非编码区域的
功能还知之甚少
对于第二部密码,目前则只能用统计学的方法进行分析
无论是第一部遗传密码,还是第二部遗传密码,都隐藏在大量的生物分子数据之中。
9.生物分子数据类型
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