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简介

FreeSurfer 是一个开源软件包，用于分析和可视化横断面和纵向研究的结构、功能和扩散神经成像数据。它由Athinoula A. Martinos 生物医学成像中心的计算神经成像实验室开发。
官网

功能

FreeSurfer 为结构 MRI 数据提供完整的处理流，包括：

  • 颅骨剥离、B1 偏置场校正和灰白质分割
  • 皮质表面模型的重建（灰白色边界面和软脑膜表面）
  • 标记皮质表面的区域以及皮质下大脑结构
  • 具有立体定向图谱的个体皮质表面的非线性配准
  • 组形态测量差异的统计分析

先决条件

FreeSurfer当前只支持Linux和MacOS系统，在Windows下使用可以使用虚拟机或者WSL安装Linux操作系统，使用WSL可以参考我写的这篇博客WSL–无需安装虚拟机和docker可以直接在Windows操作系统上使用Linux操作系统

安装

  1. 使用MobaXterm连接已经安装好的Linux操作系统

  2. cd到HOME目录

  3. wget https://surfer.nmr.mgh.har

本文标签： 教程 Windows Freesurfer

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