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2024年3月13日发(作者：亚嵌教育)

蛋白质序列分析

蛋白质序列的基本性质分析是蛋白质序列分析的基本方面，一般包括蛋白质的氨基酸组成，分

子质量，等电点，亲水性，和疏水性、信号肽，跨膜区及结构功能域的分析等到。蛋白质的很多功

能特征可直接由分析其序列而获得。例如，疏水性图谱可通知来预测跨膜螺旋。同时，也有很多短

片段被细胞用来将目的蛋白质向特定细胞器进行转移的靶标(其中最典型的例子是在羧基端含有

KDEL序列特征的蛋白质将被引向内质网。WEB中有很多此类资源用于帮助预测蛋白质的功能。

基本理化性质分析：

信号肽预测：

在生物内，蛋白质的合成场所与功能场所常被一层或多层细胞膜所隔开，这样就涉及到蛋白质

的转运。合成的蛋白质只有准确地定向运行才能保证生命活动的正常进行。一般来说，蛋白质的定

位的信息存在于该蛋白质自身结构中，并通过与膜上特殊的受体相互作用而得以表达。在起始密码

子之后，有一段编码疏水性氨基酸序列的RNA片段，这个氨基酸序列就这个氨基酸序列就是信号

肽序列。含有信号肽的蛋白质一般都是分泌到细胞外，可能作为重要的细胞因子起作用，从而具有

潜在的应用价值。

糖基化位点预测：

跨膜区分析：TMORED

蛋白质序列含有跨膜区提示它可能作为膜受体起作用，也可能是定位于膜的锚定蛋白或者离子

通道蛋白等，从而，含有跨膜区的蛋白质往往和细胞的功能状态密切相关。

蛋白酶的结构功能进行预测和分析：

同源建模分析：

二级结构及折叠类预测：Predictprotein

特殊结构或结构预测：COILS MacStripe

疏水性分析：ExPASy的ProtScale

基于序列同源性分析的蛋白质功能预测：

至少有80个氨基酸长度范围内具有25%以上序列一致性才提示可能的显着性意义。类似于核

酸序列同源性分析，用户直接将待分析的蛋白质序列输入NCBI/BLAST()，选择程序BLASTP就可

网上分析。

基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测

蛋白质的磷酸化与糖基化对蛋白质的功能影响很大，所以对其的分析也是生物信息学的一个部

分。同时，分子进化方面的研究表明，蛋白质的不同区域具有不同的进化速率，一些氨基酸必须在

进化过程中足够保守以实现蛋白质的功能。在序列模式的鉴定方面有两类技术，第一类是依赖于和

一致性序列(consensus sequence)或基序各残基的匹配模式，该技术可用于十分容易并快速搜索

motif数据库。

Motif数据库-PROSITE


本文标签： 蛋白质 序列 分析 功能 预测

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