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2024年3月22日发(作者：context方法)
VASP使用手册手册使用VASP使用
VASP使用手册
(完善中)
基础(前提)知识
Linux系统文字界面的基础操作
*会进一个特定的目录下，学会建立，删除，移动，复制目录和文件，掌握vim文字
处理程序(可以理解成Windows下的文本文档(*.txt)，但是功能更强，可以在里面编辑脚
本程序，fortran或者C语言程序)建议参见网页里面的内容非常详尽还有很多例子，看时
建议抓住重点看
关于origin(用来画DOS图)和VESTA(用来显示几何结构和电子结构)都非常容易
学，会基本操作就可，遇到问题可以上网查查或与同学交流
在Linux系统下计算软件VASP的使用
一、建好5个输入文件(POSCAR, INCAR, POTCAR, KPOINTS, 一个提交文件)
1， POSCAR
手动建立，vi POSCAR…..
还可以在MS的帮助下建立
2， INCAR
咱们组有公用标准的INCAR文件，进行不同的计算只需改其中的几个参数就可以
了
3， POTCAR
从cluster上的某个目录下面拷贝过来，放到要计算的目录里
如果要算多个元素的体系，使用命令
Eg: cat POTCAR-Ni POTCAR-Pt > POTCAR
4, KPOINTS文件，从别处拷贝一个，修改里面的参数即可
5，提交文件都可以用现成的，在老节点上(node1~node21)使用
新节点上使用yzx8vasp (记不清了，用绿衬底标出)
二、在服务器上编译vasp，一般管理员或别的用户以及编译过了，本平台编译好的
目录在
/public/home/zslu/my-soft/vasp.5.2或/public/baoer/vasp.5.2，编译使用的
mpi可能不同。
将上面目录下的可执行文件vasp拷贝到用户工作目录下或者在作业提交脚本里通过
目
录找到可执行文件vasp。
三、提交任务
使用命令
qsub 或者 qsub yzx8vasp
之后会自动产生例如的字样，这个8026表示的就是你提交的这个
任务的任务号码
四、查看任务
qstat –a 或qstat -n
一般只需要看3列
第一列:任务序号
第二列:使用者账户
最后一列:计算消耗的时间
五、杀某一个任务
由于任务提错了或别的原因，不想要算某一个任务了。杀死(删除)这个任务使用命
令:eg : qdel 8024 意思为删除任务号为8024的任务
六、提取有用信息
任务结束后，任务序列号就会消失，这时进入计算的目录
可以删除的文件，计算完成后
有用的文件为(OUTCAR，CONTCAR，CHG，OSZCAR，DOSCAR) 1(在OUTCAR
中看费米能级
grep “Fermi ” OUTCAR 最后一个结果就是
2(CHG是用来看电荷密度图的
将CHG下载到电脑上，放到VESTA中看电荷密度图
3(CONTCAR放到VESTA中看几何结构图
4(从OSCAR中可以快速的查找到计算的总自由能
最后一行，“F = ” 后面的值即是
5(DOSCAR中存放的是态密度信息
使用杨宗献老师编的fortran小程序处理DOSCAR，用命令trandos.x DOSCAR之
后会产生一个total文件，将total文件下载到电脑中，导入到origin画图软件即可看到
态密度信息。(前提是会使用origin的基本导入和画图功能)
七、最常用的计算
1(结构优化
目的是找到最优结构
对于晶胞，要找出能量最低的晶格常数，具体可以参照金刚石结构Si的那个例子 对
于表面，更加简单 :在POSCAR中确定优化的原子层数，在INCAR中修改IBRION =2，
POTIM=0.2， NSW=200三个参数即可，对于参数的意义看苏长荣或侯柱峰的中文说明
就行了
2(单点能自洽计算
目的是得到CHG画电荷密度图，以及得到正确的费米能级值，以及体系的总能量。
将结构优化的结果中使用命令 copy CONTCAR POSCAR 然后修改INCAR中令NSW=0
3(态密度计算
4(震动频率的计算
5(NEB求过渡态的计算
关于金刚石结构Si的计算例子(包括结构优化，单点自洽计算，态密度，能带结构计
算)，
网上有很多，大家练一练。对于VASP计算的整体过程有一个大概的理解。随着使用
次数的
增多，会越来越熟悉。
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