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2024年5月1日发(作者:matlab下载百度网盘资源)

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res,Feb.2021,Vol 38, No2

• 179 •

•论著•

利用生物信息学分析

CALHM

2在非小细胞肺癌中的表达及

临床意义

刘洁1黄伟2王磊

(1.南华大学附属长沙中心医院,湖南长沙410004;2.中南大学湘雅医院,湖南长沙 410008;3•中南

大学基础医学院,湖南长沙410008)

[摘要]【目的】基于

TCGA

GEO

等数据库收录肿瘤高通量数据,分析钙稳态调节家族蛋白

2(CAL-

H M2

)等

C ALH Ms

家族基因在非小细胞肺癌癌(

NSCLC)

中的表达及临床价值。【方法】利用

Oncomine

GEPIA

UALCAN

等在线工具分析和验证

CALHMs(CALHM

6)

家族基因在

NSCLC

的表达水平;利用

Human protein Atlas(HPA)

分析

CALHM2

NSCLC

中的蛋白水平和定位;利用

GEPIA

UALCAN

分析

CALHM2

表达水平与

NSCLC

癌患者病理分期、淋巴结转移、

p53

突变和吸烟史的相关性;利用

UALCAN

CALHM2

启动子甲基化水平;利用

Kaplan-Meier Plotter

分析

CALHM2

表达水平与

NSCLC

患者总生存

期(

OS

),首次进展生存期(

FP)

及进展后生存期(

PPS)

的相关性;利用

LinkedOmics

分析

NSCLC

中与

CAL-

HM2

表达的显著相关的基因,并利用

Metascape

进行

GO

功能富集。【结果】

CALHM2

NSCLC

组织中的

表达水平显著下调;在

NSCLC

组织中

CALHM2

蛋白水平也显著降低。

CALHM2

表达水平与

NSCLC

患者

病理分期、淋巴结转移、

p53

突变和吸烟史无显著相关性。

Kaplan-Meier Plotter

分析结果显示,

CALHM2

表达的

NSCLC

患者的

OS

FP

均显著优于

CALHM2

低表达患者。

LinckedOmics

共筛查得到

265

个与

CALHM2

显著相关基因,且

Metascape

富集分析显示

CALHM2

相关基因显著富集于淋巴细胞活化和迁移,

免疫激活相关;过程、细胞因子释放调控等过程。【结论】在

NSCLC

CALHM2

表达显著下调,其可作为

NSCLC

患者预后的判断标志物。

[关键词]癌,非小细胞肺/遗传学;癌,非小细胞肺/病理学

Evaluating Expression and Clinical Value of CALHM2 in Non-small Cell Lung Cancer Through

Bioinformatics Data Analysis

LIU Jie, HUANG Wei, WANG Lei

(

Changsha Central

Hospital

University of South China

Changsha

Hunan

^

410004, China )

[Abstract]

Objective】Based on the high-throughput tumor data in TCGA and GEO,the expression and

clinical value of CALHMs family genes such as CALHM2 in non-small cell lung cancer were analyzed. [Meth-

ods】Using online tools like Oncomine, GEPIA and UALCAN to analyze and verify the expression level of

CALHMs (CALHM1-6) family genes in non-small cell lung cancer(NSCLC); Using Human protein Atlas

(HPA) to analyze the protein level and location of CALHM2 in NSCLC tissues

Using GEPIA and UALCAN

to analyze the correlations between CALHM2 expression level and pathological stage, lymph node metastasis,

p53 mutation and smoking history in patients with NSCLC

Using UALCAN to investigate promoter methyla-

tion of CALHM2 in NSCLC

Using Kaplan-Meier Plotter to analyze the relationship between CALHM2 ex­

pression level and prognosis of NSCLC including overall survival (OS), first-time progression survival (FP)

and post-progression survival (PPS

);

Using LinkedOmics to analyze the genes that were significantly related

to CALHM2 expression in NSCLC

Using Metascape to perform GO function enrichment with CALHM2 cor-

related genes.

Results】The expression of C ALH M2 was significantly down-regulated in NSGLC tissue; CAL-

HM2 protein was also significantly reduced in NSCLC tissue. The expression of CALHM2 showed no signifi­

cant correlation with pathological stage» lymph node metastasis, p53 mutation and smoking history in NSCLC

通讯作者,

E-mail:***************.cn

• 180 •

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res

Feb.2021,Vol 38, No2

patients. Kaplan-Meier Plotter analysis showed that NSCLC patients with high CALHM2 expression had sig­

nificantly better OS and FP than those with low CALHM2. LinckedOmics screened a total of 265 genes signifi­

cantly related to CALHM2, and Metascape enrichment analysis showed that CALHM2 related genes were sig-

nificantly enriched in lymphocyte activation and migration, immune activation-related processes, and cytokine

release regulation. [ConclusionJCALHM2 is significantly downregulated in NSCLC and can be used as a prog­

nostic marker for patients with NSCLC.

[Key words] Carcinoma, Non-Small-Cell Lung/GE

Carcinoma

Non-Small-Cell Lung/PA

[

中图分类号

]R730.26 [

文献标识码

]A [doi:10_3969/.l671-7171.2021.02.006][

文章编号

]1671-7171(2021)02-0179,188-07

肺癌是我国和全球发病率和死亡率最高的恶性

库(

https

://

www

.

oncomine

.

org

/)中的基因芯片数

肿瘤。随着肿瘤基础和临床研究逐步提高和进步,

据,分析

CALHM

家族基因在肺癌中的表达水平。

肺癌的病死率总体呈下降趋势,但是根据最新统计

数据检索和筛选步骤:1)分别输人:

CALHM

1,

数据,肺癌每年导致的死亡人数仍然巨大,占所有肿

CALHM

2,

CALHM

3,

CALHM

4 (

FAM

26

D

),

瘤死亡总数的四分之一,大于排名2〜4位的乳腺

CALHM

5(

FAM

26

E

),

CALHM

6(

FAM

26

F

)进行

癌、前列腺癌和结直肠癌死亡病例总数。以肺腺癌

检索;2)点击肺癌数据集,进入肺癌相关数据集界

(Lung

adenocarcinoma

LUAD

)和肺鱗癌

(Lung

面;3)分别点击各数据集,记录基因表达倍数和

P

squamous

cell

carcinoma

,

I

;

USC

)为代表的非小细

值。

胞肺癌

(Non

small

cell

lung

cancer

,

NSCLC

)是肺

1.2

GEHA

数据库分析

GEPIA

数据库(

http

://

癌的主要病理类型,其在所有肺癌类型中的占比高

gepia

.

cancer

-

pku

.

cn

/ )整合了

TCGA

GTEx

中的

达85%[13]。因此继续深入研究以

NSCLC

为代表

基因表达数据[8],因此,利用

GEPIA

验证

CALHMs

的肺癌发病机制,鉴定肺癌发生发展相关的关键基

家族基因在肺癌中的表达情况以及其表达与临床分

因,是开发肺癌诊疗提供新的靶点的有效途径。

期的相关性。利用

Expression

DIY

模块中的

Box

-

轉稳态调节家族蛋白家族

(Calcium

homeosta

­

plot

Stage

plot

进行表达 和分期 分析。 “

Gene

”框

sis

modulators

,

CALHMs

) 是 一类重要的膜蛋白离

输人基因名,“

Datasets

Selection

”框选择

子通道蛋白,由

CALHM

1,

C

.

ALHM

2,

CALHM

3,

LUAD

&

LUSC

,其它选择默认选项,然后点击

CALHM

4,

CALHM

5 和

CALHM

6 等组成。同其

Plot

”分析数据,最后分别下载

PDF

箱式图和小提

它钙离子通道相关蛋白一样,

CALHMs

家族蛋白能

琴图进行数据分析。

介导细胞或亚细胞器的钙离子和其它离子的跨膜运

1.3

Human

Protein

Atlas

(

HPA

)

分析

Human

输[4]。钙离子是细胞内外信号传递的重要信使,在

Protein

Atlas

(

http

: //

www

_

proteinatlas

.

org

/)中收

细胞稳态维持具有重要作用,其信号异常与包括肿

录了各个蛋白在正常组织和癌组织中的表达数据,

瘤在内的众多病理进程相关。作为钙离子信号的传

本研究利用其数据验证

CALHM

2在正常肺组织和

递载体,钙离子通道蛋白的表达和活性异常是导致

肺癌组织中的蛋白水平。“

Search

”框输人‘

CAL

-

钙信号异常的重要原因,是肿瘤诊断和治疗的理想

HM

2,,点击“

Search

”,随后分别点击“

Tissue

”和

耙点[5—7]。目前已知妈池调控妈离子进人(

Store

-

op

-

Pathology

”,随后分别选取 “

lung

” 和

“lung

canc

­

erated

calcium

channel

),电压门离子通道等通道蛋

er

”,然后下载选取代表性图片用于数据分析。

白的异常参与了肺癌发生和发展,在肺癌诊断和治

1.4

UALCAN

数据库分析

UALCAN

数据库中

疗中具有良好的应用前景[6’7]。因此,本文基于多个

(

http

://

ualcan

.

path

.

uab

.

edu

/)整合了

TCGA

中的

肿瘤相关数据库,系统分析了

CALHMs

家族在肺

基因表达、甲基化及蛋白等数据,配套的临床资料数

癌中的表达及临床意义,为揭示和评价

CALHMs

据和部分癌种的蛋白组数据[9]。本研究利用

UAL

-

在肺癌中的作用和应用前景指明方向。

CAN

分析了

CALHM

2表达与肺癌患者的临床参

数的相关性和

1材料与方法

CALHM

2在

LUAD

中的蛋白水平。

基本操作如下:点击

“TCGA

analysis

”,在

“Scan

by

1.1

Oncomine

数据库分析

利用

Oncomine

数据

gene

(

s

),,中输人“

CALHM

2

,,,“TCGA

dataset

”框中

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res,Feb.2021, Vol 38, No2• 181 •

分别选择

“Lung

adenocarcinoma

” 和

“Lung

squa

­

mous

cell

carcinoma

”, 在返 回结果 中点击“

Expres

-

sion

”,随后返回

CALHM

2表达结果,点击右上方的

下拉框,分别选择不同的临床资料参数.分析

CAL

-

2结果

首先,利用

Oncomine

数据总体分析了钙稳态调节

2.1

Oncomine

数据显示

CALHM

2

在肺癌中的表达

蛋白家族

CALHM

1-6在所有肺癌和正常组织中的表

达水平。基因表达的总体预览(图1)显示,

CALHM

2

在肺癌中呈显著低表达,而

CALHM

1,

CALHM

3,

HM

2表达水平与临床参数的关系,下载

PDF

图片,

记录下方的统计数值;点击“

Methylation

”,分析

CALHM

2的启动子甲基化水平。利用

UALCAN

的“

CPTAC

”模块,分析

CALHM

2在

LUAD

中的蛋

白水平,操作类似表达分析。

1.5

Kaplan-Meier

Plotter

数据库

Kaplan-Meier

CALHM

4(

FAM

26

D

),

CALHM

5(

FAM

26

E

)和

CAL

-

HM

6(

FAM

26

F

)在正常组织和肺癌中的表达无显著

差异。进一步分析各个数据集中的数据显示(表1),

包含大细胞癌和

IAJAD

的多个数据集的结果再次证

CALHM

2在

NSCLC

中表达显著降低;在

LUSC

中,

CALHM

2呈下调趋势,但是无显著差异,可能与

纳人的标本数量太少有关。

Plotter

数据库(

https

: //

kmplot

.

com

/

analysis

/)中

整合了

TCGA

GEO

中各种肿瘤的基因表达与肿

瘤预后的数据[1°]。本研究利用其分析

CALHM

2与

肺癌患者预后的关系。点击“

mRNA

(

gene

chip

)”中

“Start

KM

Plotter

for

lung

cancer

”,在

“Affy

id

/

CALHM family

Gene

symbol

” 中输人

CALHM

2 家族基因

,“Split

patients

by

”选择

“Auto

select

best

cutoff

’’,然后在

Surviva

丨”选项中分别选择“

OS(overall

survival

),

Analysis Tvp< bv Cancer

1

Cancer

ws.

Normal

2

Cancer

Normal

Vi.

3

Cancer

vs.

Normal

4

Cancer

vs.

Normal

5

Cancer

vs.

Normal

6

Canci-i

Normal

V*.

FP(First

progression

)和

PPS

(

Post-progression

su

-

vrvial

) ” 进行预后分析,点击 “

Draw

Kaplan-Meier

plot

”获取结果,下载

PDF

数据进行图片制作。

1.6

LinkedOmics

数据库

LinkedOmics

数据库

Bladder Cancer

8rain and CNS Cancer

Breast Cancer

Cervical Cancer

Coioreciai Cancer

Esophageal Cancer

Head and Neck Cancer

Kidney Cancer

Leukemia

liver Cancer

Lung Cancer

Lymphoma

Melanoma

Myeloma

Ovarian Cancer

Pancreatic Cancer

Prosuie Cancer

Sarconu

Significant Unique Analyses

Total Unique Analyses

232

(

http

: //

www

.

linkedomics

.

org

/)同样整合了

TC

-

2

B

_

ki

GA

中的相关数据[11],本研究利用其分析

CALHM

2

在肺癌中的相关基因。具体操作如下:点击首页的

“Enter

as

Guest

”或注册账号后登陆进人分析数据

界面;在“

Stepl

”中分布选择

TCGA

LUAD

/

LUSC

Step

2 ” 中选择 “

HiSeq

RN

A

”,“

Step

3 ’’ 中输人

CALHM

2”,“

Step

4”中继续选择

“HiSeq

RNA

”,

然后在“

Step

5”中选择

“Pearson

Correlation

Test

”,

等待数据分析完毕后,下载相关基因的列表数据,按

照相关系数绝对值大于0.5,

P

值小于0.001为阈值,

分别筛选

LUAD

LUSC

中的相关基因后,取交

集,得到最终的相关基因,然后进行后续的

GO

富集

分析。

1.7

富集分析

1

B

4

367

5

i

1

209

235

2

2S1

14 1

280

钙稳态调节蛋白家族

CALHM1-6

在肺癌和正常组织中的表

达水平

表1

CALHM

2在

Oncomine

收录的肺癌数据集中的表达水平

名称

组织类型

大细胞癌(65)

vs

正常组织(19)

P

倍数

-2.444

-1.517

— 1.695

-1.384

-1.759

— 1.263

GEO

ID

GSE

19188

GSE

32863

GSE

7670

GSE

10072

GSE

31210

GSE

3268

Hou

Selamat

Su

Landi

Okayama

Wachi

4.52

E

-10

1.16

E

-19

2.84

E

-6

4.63

E

-12

4.88

E

-9

0.099

LUAD

(58)

vs

正常组织(58)

LUAD

(30)

vs

正常组织(27)

LUAD

(58)

vs

正常组织(49)

LUAD

(226)

vs

正常组织(20)

LUSC

(5)

vs

正常组织(5)

cape

.

org

/

gp

/

index

,

html

# /

main

/

stepl

)数据库对

CALHM

2相关基因进行富集分析[12]。操作步骤如

下:将相关基因粘贴至“

Stepl

”中的输人框中,点击

2.2

利用

GEPIA

数据验证

CALHM

家族基因在

肺癌中的表达水平

随后,利用

GEPIA

进一步分析

Submit

; “

SteP

2”选择默认参数;最后“

Step

3 ”点击

Custom

Analysis

,进入结果页,下载相关结果。

和验证了

CALHM

家族基因在

LUAD

LUSC

的表达水平。结果显示(图2),与

Oncomine

数据库

的分析结果一致,

CALHM

2在

LUAD

LUSC

的表达水平均显著低于正常肺组织;而其他家族成

• 182 •

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

JClinRes,Feb.2021, Vol38, N

q

2

员在

LUAD

LUSC

中的表达水平与正常组织无

明显差异。基于

CALHM

2在肺癌中的

HPA

数据

TCGA

质谱数据显示

CALHM

2蛋白在

LUAD

LUSC

组织呈低表达。

CALHM1

果同样证实

CALHM

2在

LUAD

中的水平显著低

于正常肺组织(《 =111

,P

<0.05),见图4。因此,

mRNA

水平一致,

CALHM

2在肺癌中表达降低。

CALHM2

Normal

CALHM2

在肺组织中呈相对高表达,在

LUAD

LUSC

组织

中呈低表达状态

Protein expression of CALHM2 in Lung adenocarcinoma

2 CALHM

家族基因在

LUAD

LUSC

中的表达水平

同时利用

HPA

数据库,分析了

CALHM

2在正

常肺组织和

LUAD

LUSC

中的蛋白水平和分布

情况。如图3所示,

CALHM

2在肺组织中呈相对高

表达,在

LUAD

LUSC

组织中呈低表达,其表达

主要分布于细胞质和细胞核。随后,利用

UALCAN

在线工具分析了

TCGA

中的肺腺蛋白表达数据,结

4 CALHM2

LUAD

LUSC

组织中相对低表达

表2

UALCAN

CALHM

2在

LUAD

LUSC

患者中的各相关因素的统计分析

相关因素

肺腺癌

肺鳞癌

样本数低

25%50%

75°/〇

高样本数

25^〇50%

75%

分期

I

2771.33

10.0515.8820.4335.122432.708.27

12.2117.68

34.34

II

1253.528.99

14.71

20.5537.18

1571.699.1512.54

16.8631.13

ni

85

3.09

10.4214.2120.04

31.5

185

3.197.38

12.3717.10

33.34

N

282.96

9.1614.9524.5838.31

7

7.8110.2614.04

16.3118.11

患者年龄

21〜40岁12

11.0319.73

26.0729.92

31.19

2

5.59

7.168.7310.30

11.87

41〜60岁902.299.38

14.60

19.6431.51

1032.388.6312.7019.2636.02

61〜80岁

1491.339.9314.6720.3635.983611.698.5212.66

17.38

32.11

81〜100岁322.96

10.81

18.7124.6739.3520

5.398.6810.1514.8722.86

淋巴结转移

3311.339.7714.9920.3435.98320

2.38

8.2012.1317.16

33.48

N

1

963.11

9.8414.1620.3538.31

1311.69

9.7212.9317.0029.61

N

274

2.96

10.36

14.3622.16

39.3540

3.196.78

10.7615.7029.48

N

32

19.98

20.52

21.06

21.6022.14

5

6.909.5513.45

19.96

21.99

性别

2381.339.4013.5019.03

33.32

366

2.38

8.06

12.0317.1032.11

276

2.29

10.0716.09

21.31

38.31

1281.6910.1813.5017.35

31.80

吸烟习惯

不吸烟

753.9310.1816.2319.68

29.33

18

4.68

9.9215.2522.92

31.80

吸烟

1182.349.38

15.0920.74

35.98

133

1.69

7.8612.6516.97

32.11

戒烟

<15年1351.339.2413.2020.94

37.1883

2.70

8.72

12.0618.88

34.74

>15年168

2.29

10.3115.0820.64

34.79247

2.848.61

12.64

17.1931.52

TP

53突变状态

突变

233

2.29

10.62

16.04

20.6434.79

369

2.387.81

12.19

16.80

31.52

非突变

2791.33

9.0114.1720.27

37.18

1181.69

9.61

12.82

18.7034.34

2.3

CALHM

2表达水平与肺癌患者临床病例因素 ~基于

UALCAN

GEPIA

•分析

CAL

-

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res,Feb.2021, Vol 38, fc2

183

HM

2表达水平与肿瘤病理特征的关系

。UALCAN

结果显示(表2),

CALHM

2在

LUAD

LUSC

者中的表达水平与分期,淋巴结转移和吸烟史无关;

CALHM

2在

LUAD

LUSC

女性患者中的表达

水平显著高于男性患者。在

LUAD

CALHM

2

的表达水平与

P

53突变状态无关;但是在

LUSC

中,

CALHM

2在

P

53突变的患者中表达显著低于

野生型

P

53患者。

GEPIA

中的结果也证实,

CAL

-

HM

2在不同分期的癌组织中表达水平相当。因

此,上述结果表明

CALHM

2的表达水平与肺癌的

病理特征无显著相关性。

2.4

CALHM

2

基因甲基化水平分析

基于

UAL

-

CAN

中的甲基化数据,分析

LUAD

LUSC

CALHM

2基因启动子的甲基化水平。结果显示

(图5),在

LUAD

和正常对照组织中,

CALHM

2的

甲基化水平无显著差异,而在

LUSC

中,

CALHM

2

的甲基化水平显著高于正常组织,提示启动子高甲

基化是

CALHM

2在

LUSC

中低表达的原因之一。

5 CALHM2

基因启动子的甲基化水平在

LUAD

LUSC

中的

表达情况

2.5

CALHM

2

表达水平与肺癌的预后

基于

Ka

-

plan-Meier

Plotter

,分析

CALHM

2表达水平与肺

癌患者预后的关系。①

CALHM

2水平与肺癌患者

总生存期的关系,结果显示(图6),

CALHM

2高表

达的患者的总体生存时间

(Overall

survival

OS

)更

长。②

CALHM

2高表达的患者的首次进展发生时

(First

progression

,

FP

)显著长于

CALHM

2 低

表达患者,但是在肿瘤进展后,

CALHM

2表达水平

与肺癌患者的生存时间无显著关系。上述结果表

明,

CALHM

2与肺癌患者的预后正相关。

2.6

CALHM

2

相关基因及功能分析

同时,利用

LinkedOmics

分别分析了

LUAD

LUSC

中表达

水平与

CALHM

2显著相关的基因

(r

>0.05,

P

<

0.01),通过取交集,包含

CALHM

2在内,共得到了

265个基因。随后利用

Metascape

对上述基因进行

GO

富集分析。结果显示,相关基因富集于淋巴

细胞活化和迁移,免疫激活相关过程、细胞因子释放

调控等过程(图7),提示

CALHM

2在免疫和炎症调

控中具有重要的功能。

OS PS PPS

3 讨论

手术切除,传统或新辅助放化疗、靶向治疗及免

疫治疗等是肺癌治疗的主要方式,上述治疗手段的

单独或联合应用显著改善了肺癌的治疗水平,但肺

癌目前仍是死亡率最高的恶性肿瘤[13]。除去少部

分诊断在早期且经手术切除后的患者取得了理想的

疗效外,大部分中晚期肺癌患者的治疗效果仍有很

大的提升空间。因此,筛选参与肺癌发生发展的新

分子,开发肺癌早期诊断和预后疗效判断的新标志

物,是提高肺癌患者总体治疗效果的重要和可行途

径。研究表明,钙信号异常是肿瘤的重要特征之一,

而钙离子通道相关基因异常在调控细胞钙信号中发

挥了重要作用〜7]。据此,本研究利用多种在线工

具综合分析了新型钙离子通道蛋白

CALHMs

家族

基因在肺癌中的表达,并重点分析了差异表达基因

CALHM

2在肺癌中的临床价值。

CALHMs

是一类新型的钙离子通道蛋白,除

CALHM

5外,

CALHMs

蛋白的晶体结构已被解

析[1318]。除了具有钙离子等离子转运功能外,

CAL

-

HMs

在星形细胞

ATP

释放、味觉细胞神经递质传

递和

NK

等淋巴细胞信号传递中发挥了重要作用,

SNP

特征和表达差异与阿茨海默病(

Alzheimer's

disease

,

AD

)、缺血性脑损伤[17]、记忆减退[18]、克罗

伊茨费尔特-雅各布病(

Creutzfeldt-Jakob

dis

-

ease

)[19]及免疫应答紊乱[2°]等病理过程相关的发生

相关,表明

CALHMs

家族具有重要的生物学功能。

尽管目前关注

CALHMs

家族在肿瘤中研究很

少,但是已有的研究证实,电压门钙离子通道

(Volt

-

• 184 •

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res,Feb.2021, Vol 38, N

p

2

age-gated

Ca

2+

Channel

VGCC

),受体门妈离子通

道(

Receptor-gated

Ca

2+

Channel

,

ROCC

)及耗池

操纵轉离子通道(

Store-operated

Ca

2+

Channel

socc

)等其他类型钙离子通道蛋白在肿瘤的恶性

转变和进展发挥了重要作用,在包括肺癌在内的肿

瘤诊断和治疗中具有良好的转化和应用价值[5’7]。

比如,电压门通道蛋白

Cav

3.1在

NSCLC

中表达显

著升高,其表达水平与肿瘤组织类型,肿瘤组织大小

及肿瘤分期相关,且

Cav

3.1高表达的肺癌患者的总

生存期和无疾病进展生存期显著低于低表达患

者[21]。与

Cav

3.1类似,

Cav

2.2蛋白同样在

NSCLC

中表达上调,与患者的恶性临床参数和预后呈负相

[22]。Zhang

等分析了

TPRC

1、3、6 及 7 等

ROCC

编码基因和

ORAI

1,

ORAI

2,

STIM

1 和

STIM

2 等

SOCC

编码基因单核酸位点多态性(

SNP

)与肺癌发

生的相关性,结果显示

TRPC

4和

TPRC

7的多个

SNP

是肺癌发生的高风险因子。同时,

TPRC

1、3、4

和6的表达水平与肺癌的分化程度呈负相关,与年

龄、性别及吸烟史等无关[23]。在本研究中,多个数

据库中的数据均显示

CALHM

2的表达和蛋白水平

在肺癌中显著降低,而其他

CALHMs

基因无显著

改变,提示

CALHM

2在肺癌中具有重要作用。

CALHM

2的表达水平与肿瘤分期,淋巴结转移,吸

烟史,

P

53突变等无显著相关性,但是

CALHM

2高

表达的肺癌患者的预后更好,其总生存时间和首次

进展时间均显著长于

CALHM

2低表达患者,表明

CALHM

2是潜在的预后判断因子。研究显示,

CALHM

6等在免疫细胞活化和应答等过程中具有

重要作用[2°],本研究中也证实

CALHM

2相关基因

显著富集于淋巴细胞分化、活化和迁移,免疫应答调

控、炎症因子和趋化因子调控等生物过程,提示

CALHM

2肺癌的免疫微环境调控中具有重要作

用。综上,笔者的研究显示

CALHM

2在肺癌中表

达降低,可作为肺癌预后判断的标志物,后续将开展

相关研究进一步明确和证实。

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(下转第

188

页)

• 188 •

医学临床研究

2021

2

月第

38

卷第

2

J Clin Res

Feb.2021, Vol 38, N

q

2

层,与既往研究[4]相符。文献报道约

75%

胃脂肪瘤

中推荐使用联和检测,能够综合考虑,兼具敏感性及

的发病部位在胃窦部[5],本组中

66.67%

发病于胃窦

准确率。因此本研究中同时分析

MSCT

联合内镜

部,略低于文献,可能与收集的病例数相关。

Sim F

检查诊断胃脂肪瘤的效能,结果显示,联合检测的

等报道[6],胃脂肪瘤发病与性别存在关系,其中女性

AUC

髙于两者单独诊断,提示联合检测能够提高诊

高于男性。本研究男:女为1 : 4,女性明显多于男

断胃脂肪瘤的准确性。

性,支持既往研究结论,提示胃脂肪瘤在中老年女性

[参考文献]

人群中更易多发。

胃脂肪瘤的临床症状并未显出特异性,目前胃

[1]

张其德,韩树堂.经内镜侧缘切开隧道技术在治疗胃黏膜下肿

瘤中的初步应用[J].中华消化内铣杂志,2017, 34(4):281-

脂肪瘤的诊断主要依靠影像学检查及内镜检查。

283.

MSCT

作为新型的影像学技术,其分辨率较高,能

[2] Koukias N, Murino A, Telese

hj et al .

Management of a rare

够对病变内部的脂肪成分准确识别[6],已有报道应

cause of significant acute upper gastrointestinal bleeding: gas­

MSCT

对胃肠道脂肪瘤进行诊断鉴别[7],但对于

tric lipoma resected by hybrid endoscopic submucosal dissec-

胃脂肪瘤的应用未见报道。本研究结果显示,胃脂

tion[J]].

Endoscopy

i

2017, 49( 10) :246-247.

肪瘤内镜检查的检出率

[3] Ko WJ, Cho JY. Current techniques for treating gastrointesti­

(69.70%)

明显低于

MSCT

nal stromal tumors in the upper gastrointestinal tract[J].

CLinl

的检出率

(90.91%)

;

MSCT

及内镜均存在部分漏检

Endosc,

2016, 49(3) :226-228.

率。进一步检查可知,漏检病理均为直径低于1

cm

[4] Miyazawa M, Matsuda M, Yano

et al .

Gastric adenocarci­

的小脂肪瘤,原因可能为其直径较小,不是引起患者

noma of the fundic gland (chief cell-predominant type) : A re­

临床症状的原因。因此对于直径低于

lcm

的胃脂

view of endoscopic and clinicopathological features[J].

World

肪瘤,检查医师的经验及操作或许也可能为造成漏

J Gastroenterol,

2016, 22(48) : 10523-10531.

[5] Cappell MS, Stevens CE, Amin M. Systematic review of giant

诊的主要原因[8]。本研究中以病理学检查为金标

gastric lipomas reported since 1980 and report of two new ca­

准,对

MSCT

及内镜检查定性诊断胃脂肪瘤进行了

ses in a review of 117110 esophagogastroduodenoscopies[J].

比较,结果显示,内镜诊断胃脂肪瘤的准确率为

World J Gastroenterol ^

2017, 23(30) :5619-5633.

73.91%

MSCT

诊断的准确率

86.96%

MSCT

的准

[6] Sun F, Sun H, Mo

X, et al .

Increased survival rates in gastric

确率明显高于内镜检查。分析其原因可能为胃脂肪

cancer, with a narrowing gender gap and widening socioeco­

nomic status gap: A period analysis from 1984 to 2013[J].

J

瘤多数起源于黏膜下层,仅有少数在浆膜下层[9],因

Gastroenterol Hepatol ^

2018» 33(4) :837-846.

此内镜检查时虽能够看到腔内隆起,但由于有黏膜

[7] Saponjski J, Stojanovich L, Petrovic J t

et al .

The role of

层覆盖,病变内部结构无法观测到,因此无法做出定

MSCT angiography in early detection of lower limb arterial le­

性诊断•检出率较低。而

MSCT

分辨率高,可准确

sions in patients with antiphospholipid syndrome[Jl.

Immunol

识别病变内的脂肪成分,其影像学特征表现为,肿瘤

Res,

2017, 65(2):482-486.

[8] Yen H,Lin K,Chen C. Gastrointestinal: Gastric lipoma as a

起源于胃壁、突向胃腔内的占位病变,且病灶与正常

rare cause of recurrent gastrointestinal bleeding [ J ].

J

组织的边界清楚,边缘规整,多数病灶均为均匀低密

Gastroenterol Hepatol ^

2018, 33(4): 771.

度,增强扫描无强化特征。此外,

MSCT

同时能够

[9] Krishnaraj B, Dhanapal B, Shankar

Gt et al .

Gastric lipoma:

清晰的显示肿瘤与周围组织的解剖关系。因此,

a rare cause of haematemesis. [J].

Ann R Coll Surg Engl

MSCT

对胃脂肪瘤的定性诊断准确率较高。但两

2018, 100(3) :l-43.

种手段单独检测均存在漏诊的概率,目前临床研究

(

本文编辑:王沪湘)[收稿日期]

2019-09-18

(上接第184页)

[22] Zhou X,Wang W, Zhang S,

et al

.Cacnalb (cav2.2) overex­

[20] Malik ural and functional annotation of human fam26f

pression and its association with clinicopathologic characteris­

A multifaceted protein having a critical role in the immune sys-

tics and unfavorable prognosis in non-small cell lung cancer

tem

[JG. Gene

2017, 597:66-75.

[J].

Dis Markers,

2017, 2017:6136401.

[21] Suo A,Childers A,DSilva

A,

et

al

.

Cav3.1 overexpression is

[23] Zhang Z. Identification of trpcs genetic variants that modify

associated with negative characteristics and prognosis in non­

risk for lung cancer based on the pathway and two-stage stud-

small cell lung cancer[J].

On

cotar get

2018, 9 (9

):

8573-

y, [J].

Meta Gene,

2016, 9:191-196.

8583.

(

本文编辑:詹道友)[收稿日期]

2021-0

11


本文标签: 肺癌 表达 水平 相关 数据