admin 管理员组

文章数量: 1184232

1. 回顾超几何分布的定义

一般地，假设共有N件产品，其中M件次品，现在从中抽取n件做检查，抽到k件次品的概率分布服从超几何分布。

数学表达式如下：

2. 超几何分布的一个应用：求解overlap显著性

  • 以一个实际的生物实验为例。

    在上述实验中，我们假设总共的基因个数为20000个（假定为产品的总数），图中左边圈的总数为2005（1740+265）个（假定为次品的总个数），现从中抽取805（540+265）个，需要计算得到基因的个数（次品数量）大于等于265的概率。

思考过程：在次品个数是少数的情况下，overlap越高，从超几何分布来看，发生的概率越小。现在的overlap是265，可能会是过高的那种情况，那么现在计算overlap是265以及大于265的概率之和，如果这个概率很小，那就说明发生265这个事件不是随机的，进而就推出来了overlap为265是显著性高的一个事件。

# 用R语言计算为:
phyper(265-1

本文标签： 几何 overlap Fisher

版权声明：本文标题：overlap的显著性检验-超几何检验Fisher`s 检验 内容由网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：http://www.roclinux.cn/b/1754940090a3052409.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。