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Protein

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ECD 是 Extracellular Domain 的缩写，指的是跨膜蛋白质的细胞外部分 (膜蛋白的胞外区)，通常包含一些功能性的结构域，如配体结合域、受体激活域、二聚化臂等。ECD 的结构和功能对于理解跨膜蛋白质的信号传导机制非常重要。UniProt 上对这部分结构域是有标注的。

UniProt 官网：UniProtKB

例如，磷脂转运 ATP 酶 ABCA1_HUMAN：


在其序列中，43~639 即是胞外区，如下：


相关的蛋白质结构 PDB 是 5XJY，即：

观察 PDB 的序列区域，如下：

  • select #1:43-639,1372-1656

胞外序列：


与 UniProt 官网序列一致，即：

关于 膜蛋白胞外区 (ECD) 是抗原的重要特性，需要重点关注与抗体的结合。

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