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2024年12月28日发(作者:lockfile崩溃)
生物化学名词解释完全版
13,内在膜蛋白〔integral membrane protein〕:插入脂双层的疏水核和完全跨
过脂双层的膜蛋白。
14,外周膜蛋白〔peripheral membrane protein〕:通过与膜脂的极性头部或内
在的膜蛋白的离子相互作用和形成氢键与膜的内或外表面弱结合的膜蛋白。
15,流体镶嵌模型〔fluid mosaic model〕:针对生物膜的结构提出的一种模型。
在那个模型中,生物膜被描述成镶嵌有蛋白质的流体脂双层,脂双层在结构和
功能上都表现出不对称性。有的蛋白质〝镶〝在脂双层表面,有的那么部分或
全部嵌入其内部,有的那么横跨整个膜。另外脂和膜蛋白能够进行横向扩散。
16,通透系数〔permeability coefficient〕:是离子或小分子扩散过脂双层膜能力
的一种量度。通透系数大小与这些离子或分子在非极性溶液中的溶解度成比
例。
17,通道蛋白〔channel protein〕:是带有中央水相通道的内在膜蛋白,它能够
使大小适合的离子或分子从膜的任一方向穿过膜。
18,〔膜〕孔蛋白〔pore protein〕:其含意与膜通道蛋白类似,只是该术语常用
于细菌。
19,被动转运〔passive transport〕:那称为易化扩散。是一种转运方式,通过
该方式溶质特异的结合于一个转运蛋白上,然后被转运过膜,但转运是沿着浓
度梯度下降方向进行的,因此被动转运不需要能量的支持。
20,主动转运〔active transport〕:一种转运方式,通过该方式溶质特异的结合
于一个转运蛋白上然后被转运过膜,与被动转运运输方式相反,主动转运是逆
着浓度梯度下降方向进行的,因此主动转运需要能量的驱动。在原发主动转运
过程中能源能够是光,ATP或电子传递;而第二级主动转运是在离子浓度梯度
下进行的。
21,协同运输〔co-transport〕:两种不同溶质的跨膜的耦联转运。能够通过一
个转运蛋白进行同一方向〔同向转运〕或反方向〔反向转运〕转运。
22,胞吞作用〔endocytosis〕:物质被质膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成〔物
质在囊泡内〕被带入到细胞内的过程。
第七章
1,核苷〔nucleoside〕:是嘌呤或嘧啶碱通过共价键与戊糖连接组成的化合物。
核糖与碱基一样差不多上由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的
β-N-糖苷键连接。
2,核苷酸〔nucleotide〕:核苷中的戊糖羟基被磷酸化形成的化合物。
3,cAMP(cycle AMP):3ˊ,5ˊ-环腺苷酸,是细胞内的第二信使,由于某些激素
或其它分子信号刺激激活腺苷酸环化酶催化ATP环化形成的。
4,磷酸二酯键〔phosphodiester linkage〕:一种化学基团,指一分子磷酸与两个
醇〔羟基〕酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核
苷的3ˊ羟基与别一个核苷的5ˊ羟基与同一分子磷酸酯化,就形成了一个磷酸二
酯键。
5,脱氧核糖核酸〔DNA〕:含有专门脱氧核糖核苷酸序列的聚脱氧核苷酸,脱
氧核苷酸之间是是通过3ˊ,5ˊ-磷酸二脂键连接的。DNA是遗传信息的载体。
6,核糖核酸〔RNA〕:通过3ˊ,5ˊ-磷酸二酯键连接形成的专门核糖核苷酸序列
的聚核糖核苷酸。
7,核糖体核糖核酸〔rRNA, ribonucleic acid〕:作为组成成分的一类 RNA,r
RNA是细胞内最丰富的 RNA .
8,信使核糖核酸(mRNA,messenger ribonucleic acid):一类用作蛋白质合成模
板的RNA .
9, 转移核糖核酸〔Trna,transfer ribonucleic acid〕:一类携带激活氨基酸,将它
带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上的RNA。tRNA含有能
识别模板mRNA上互补密码的反密码子。
10,转化〔作用〕〔transformation〕:一个外源DNA 通过某种途径导入一个宿
主菌内,引起该菌的遗传特性改变的作用。
11,转导〔作用〕〔transduction〕:借助于病毒载体,遗传信息从一个细胞转移
到另一个细胞。
12,碱基对〔base pair〕:通过碱基之间氢键配对的核酸链中的两个核苷酸,例
如A与T或U , 以及G与C配对 。
13,夏格夫法那么〔Chargaff’s rules〕:所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔
含量相等〔A=T〕,鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔含量相等〔G=C〕,即嘌呤的总含量
与嘧啶的总含量相等〔A+G=T+C〕。DNA的碱基组成具有种的特异性,但没有
组织和器官的特异性。另外,生长和发育时期`营养状态和环境的改变都不阻碍
DNA的碱基组成。
14,DNA的双螺旋〔DNA double helix〕:一种核酸的构象,在该构象中,两
条反向平行的多核甘酸链相互缠绕形成一个右手的双螺旋结构。碱基位于双螺
旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。碱基平
面与假象的中心轴垂直,糖环平面那么与轴平行,两条链皆为右手螺旋。双螺
旋的直径为2nm,碱基堆积距离为0.34nm, 两核甘酸之间的夹角是36゜,每
对螺旋由10对碱基组成,碱基按A-T,G-C配对互补,彼此以氢键相联系。坚
持DNA双螺旋结构的稳固的力要紧是碱基堆积力。双螺旋表面有两条宽窄`深
浅不一的一个大沟和一个小沟。
15.大沟〔major groove〕和小沟〔minor groove〕:绕B-DNA双螺旋表面上显
现的螺旋槽〔沟〕,宽的沟称为大沟,窄的沟称为小沟。大沟、小沟差不多上
由于碱基对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。
16.DNA超螺旋〔DNA super coiling〕:DNA本身的卷曲一样是DNA双`螺旋
的弯曲欠旋〔负超螺旋〕或过旋〔正超螺旋〕的结果。
17.拓扑异构酶〔topoisomerase〕:通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二
酯键,然后重新缠绕和封口来改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶Ⅰ、通过切
断DNA中的一条链减少负超螺旋,增加一个连环数。某些拓扑异构酶Ⅱ也称
为DNA促旋酶。
18.核小体〔nucleosome〕:用于包装染色质的结构单位,是由DNA链缠绕一
个组蛋白核构成的。
19.染色质〔chromatin〕: 是存在于真核生物间期细胞核内,易被碱性染料着
色的一种无定形物质。染色质中含有作为骨架的完整的双链DNA,以及组蛋白、
非组蛋白和少量的DNA。
20.染色体〔chromosome〕:是染色质在细胞分裂过程中通过紧密缠绕、折叠、
凝缩和精细包装形成的具有固定形状的遗传物质存在形式。简而言之,染色体
是一个大的单一的双链DNA分子与相关蛋白质组成的复合物,DNA中含有许
多贮存和传递遗传信息的基因。
21.DNA变性〔DNA denaturation〕:DNA双螺旋链解链,分离成两条单链的
现象,不涉及共价键的断裂。
22.退火〔annealing〕:即DNA由单链复性、变成双链结构的过程。来源相同
的DNA单链经退火后完全复原双链结构的过程,同源DNA之间、DNA和R
NA之间,退火后形成杂交分子。
23.熔解温度〔melting temperature,Tm〕:双链DNA熔解完全变成单链DNA
的温度范畴的中点温度。
24.增色效应〔hyperchromic effect〕:当双螺旋DNA熔解〔解链〕时,260nm
处紫外吸取增加的现象。
25.减色效应〔hypochromic effect〕:随着核酸复性,紫外吸取降低的现象。
26.核酸内切酶〔endonuclease〕: 核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核
酸分子内磷酸二酯键的酶。
27.核酸外切酶〔exonuclease〕:从核酸链的一端逐个水解核苷酸的酶。
28.限制性内切酶〔restriction endonuclease〕:一种在专门核苷酸序列处水解双
链DNA的内切酶。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非
甲基化的DNA的水解;而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。
29.限制酶图谱〔restriction map〕:同一DNA用不同的限制酶进行切割,从而
获得各种限制酶的切割位点,由此建立的位点图谱有助于对DNA的结构进行
分析。
30.反向重复序列〔inverted repeat sequence〕:在同一多核苷酸内的相反方向
上存在的重复的核苷酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的
形成。
31.重组DNA技术〔recombination DNA technology〕:也称之为基因工程〔g
enomic engineering〕.利用限制性内切酶和载体,按照预先设计的要求,将一种
生物的某种目的基因和载体DNA重组后转入另一生物细胞中进行复制、转录
和表达的技术。
32.基因〔gene〕:也称为顺反子〔cistron〕.泛指被转录的一个DNA片段。在
某些情形下,基因常用来指编码一个功能蛋白或DNA分子的DNA片段
。
指携带有遗传信息的DNA或RNA序列,也称为遗传因子,是操纵性状的差不多
遗传单位。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而操
纵生物个体的性状表现。
第八章
1,分解代谢反应〔catabolic reaction〕:降解复杂分子为生物体提供小的构件分
子和能量的代谢反应。
2,合成代谢反应〔anablic reaction〕:合成用于细胞坚持和生长所需分子的代
谢反应。
3,反馈抑制〔feedback inbition〕:催化一个代谢途径中前面反应的酶受到同一
途径终产物抑制的现象
4,前馈激活〔feed-forward activition〕:代谢途径中一个酶被该途径中前面产
生的代谢物激活的现象。
5,标准自由能变化〔△G
O
〕:相应于在一系列标准条件〔温度298K,压力1at
m〔=101.325KPa〕,所有溶质的浓度差不多上mol/L〕下发生的反应自由能变化。
△G
O′
表示pH7.0条件下的标准自由能变化。
6,标准还原电动势〔E
O′
〕:25℃和pH7.0条件下,还原剂和它的氧化形式在1
mol/L浓度下表现出的电动势.
第九章
1,酵解〔glycolysis〕:由10步酶促反应组成的糖分解代谢途径。通过该途径,
一分子葡萄糖转化为两分子丙酮酸,同时净生成两分子ATP和两分子NADH。
2,发酵〔fermentation〕:营养分子〔Eg葡萄糖〕产能的厌氧降解。在乙醇发
酵中,丙酮酸转化为乙醇和CO
2
。
3,巴斯德效应〔Pasteur effect〕:氧存在下,酵解速度放慢的现象。
4,底物水平磷酸化〔substrate phosphorlation〕:ADP或某些其它的核苷-5′—二
磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的。这种磷酸
化与电子的传递链无关。
5,柠檬酸循环〔citric acid cycle〕:也称为三羧酸循环〔TAC〕、Krebs循环。
是用于乙酰CoA中的乙酰基氧化成CO
2
的酶促反应的循环系统,该循环的第
一步是由乙酰CoA经草酰乙酸缩合形成柠檬酸。
6,回补反应(anaplerotic reaction):酶催化的,补充柠檬酸循环中间代谢物供给
的反应,例如由丙酮酸羧化酶生成草酰乙酸的反应。
7,乙醛酸循环〔glyoxylate cycle〕:是某些植物、细菌和酵母中柠檬酸循环的
修改形式,通过该循环能够使乙酰CoA经草酰乙酸净生成葡萄糖。乙醛酸循围
绕过了柠檬酸循环中生成两个CO
2
的步骤
第十章
1,戊糖磷酸途径〔pentose phosphare pathway〕:那称为磷酸戊糖支路。是一个
葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。该途径包括氧化和非
氧化两个时期,在氧化时期,葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO
2
,并生
成两分子NADPH;在非氧化时期,核酮糖-5-磷酸异构化生成核糖-5-磷酸或转
化为酵解的两用人才个中间代谢物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。
2,糖醛酸途径〔glucuronate pathway〕:从葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸开始,
经UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗坏血酸的途径。但只有在植物和那些
能够合成抗坏血酸的动物体内,才能够通过该途径合成维生素C。
3,无效循环〔futile cycle〕:也称为底物循环。一对酶催化的循环反应,该循
环通过ATP的水解导致热能的开释。Eg葡萄糖+ATP=葡萄糖6-磷酸+ADP与
葡萄糖6-磷酸+H
2
O=葡萄糖+P i反应组成的循环反应,其净反应实际上是AT
P+H
2
O=ADP+Pi。
4,磷酸解〔phosphorolysis〕作用::通过在分子内引入一个无机磷酸,形成磷
酸脂键而使原先键断裂的方式。实际上引入了一个磷酰基。
5,半乳糖血症〔galactosemia〕:人类的一种基因型遗传代谢缺陷,是由于缺
乏1-磷酸半乳糖尿苷酰转移酶,导致婴儿不能代谢奶汁中乳糖分解生成的半
乳糖。
6,尾部生长〔tailward growth〕:一种聚合反应机理通过私有化的单体的头部
结合到聚合的尾部,连接到聚合物尾部的单体的尾部又生成了接下一个单体的
受体。
7,糖异生作用〔gluconenogenesis〕:由简单的非糖前体转变为糖的过程。糖
异生不是糖酵解的简单逆转。尽管由丙酮酸开始的糖异生利用了糖酵解中的七
步近似平稳反应的逆反应,但还必需利用另外四步酵解中不曾显现的酶促反
应,绕过酵解过程中不可逆的三个反应。
第十一章
1,呼吸电子传递链〔respiratory electron-transport chain〕:由一系列可作为电
子载体的酶复合体和辅助因子构成,可今后自还原型辅酶或底物的电子传递给
有氧代谢的最终的电子受体分子氧〔O
2
〕
2,氧化磷酸化〔oxidative phosphorylation〕:电子从一个底物传递给分子氧的
氧化或酶催化的由ADP和Pi生成ATP与磷酸化相偶联的过程。相伴电子
从底物到氧的传递,ADP被磷酸化形成ATP的酶促过程,包括底物水平磷酸
化和电子传递链磷酸化。沈同生化下册P130。
3,化学渗透理论〔chemiosmotic theory〕:一种学说,要紧论点是底物氧化期
间建立的质子浓度梯度提供了驱动ADP和Pi形成ATP的能量。
4,解偶联剂〔uncoupling agent〕:一种使电子传递与ADP磷酸化之间的紧
密偶联关系解除的化合物,Eg:2,4-二硝基苯酚。
5,P/O比〔P/O ratio〕:在氧化磷酸化中,每1/2 O
2
被还原成ADP的摩尔数。
电子从NADH传递给O
2
时,P/O=3,而电子从FADH
2
传递给O
2
时,P/O=
2。
6,高能化合物〔high energy compound〕:在标准条件下水解时,自由能大幅度
减少的化合物。一样是指水解开释的能量能驱动ADP磷酸化合成ATP的化合
物。
第十二章
1,叶绿体(chloroplast):藻类和植物体中含有叶绿素进行光合作用的器官。
2,叶绿素〔chlorophyll〕:光合作用膜中的绿色色素,它是光合作用中捕捉光
能的要紧成分。
3,辅助色素〔accessory pigment〕:在植物和光合细菌,像类胡萝卜素、叶黄
素和藻胆色素中,吸取可见光的色素,这类色素是对叶绿素捕捉光能的补充。
4,光合作用〔photosynthesis〕:绿色植物或光合细菌利用光能将CO
2
转化为
的有机化合物的过程。
5, 光合磷酸化〔photophosphorylation〕:在叶绿体ATP合成酶的催化下依靠于
光能由ADP 和Pi合成的ATP过程。
6,光反应〔light reaction〕:光合色素将光能转变成化学能并形成ATP 和NA
DPH的过程。
7,暗反应(dark reaction):利用光反应生成的ATP和NADPH的化学能使CO
2
还原成糖或其它有机物的一系列酶促过程。
8,卡尔文循环〔Calvin cycle〕:也称为还原戊糖磷酸循环和C3途径。它是在
光合作用期间将CO
2
还原转化为糖的反应循环,是植物用于固定CO
2
生成磷酸
戊糖的途径。
9,C4途径(C4 pathway):一些植物中固定C的途径,其特点是通过使CO
2
浓
缩减少光呼吸。在该途径中,叶肉细胞CO
2
被整合到C4酸中,然后C4酸在
维管束鞘细胞被脱羧,开释出的CO
2
被卡尔文循环利用。
10,光呼吸〔photorespiration〕:植物依靠光进行磷酸乙醇酸代谢的过程。光呼
吸之因此发生是由于O
2
能够与CO
2
竞争核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶的活性部位。
第十三章
1,脂肪酸的β氧化〔β-oxidation〕:脂肪酸氧化降解生成乙酰CoA,同时生成
NADH 和FADH
2
,因此可产生大量的ATP。该途径因脱氢和裂解均发生在β
位碳原子而得名。每一轮脂肪酸β氧化都由四步反应组成:氧化、水化、再氧
化和硫解。
2,肉毒碱穿梭系统〔carnitine shuttle system〕:脂酰CoA通过形成脂酰肉毒碱
从细胞质转运到线粒体的一个穿梭循环途径。
3,酮体〔acetone body〕:在肝脏中由乙酰CoA合成的燃料分子〔β羟基丁酸,
乙酰乙酸和丙酮〕。在饥饿期间酮体是包括脑在内的许多组织的燃料,酮体过
多会导致中毒。
4,柠檬酸转运系统〔citrate transport system〕:将乙酰CoA从线粒体转运到细
胞质的穿梭循环途径。在转运乙酰CoA的同时,细胞质中NADH氧化成NAD
﹢,NADP+还原为NADPH。每循环一次消耗两分子ATP.
5,酰基载体蛋白〔ACP〕:通过硫酯键结合脂肪酸合成的中间代谢物的蛋白质〔原
核生物〕或蛋白质的结构域〔真核生物〕。
第十四章
氨基酸的代谢
1,生物固氮作用〔biological nitrogen fixatio〕:大气中的氮被原还为氨的过程。
生物固氮只发生在少数的细菌和藻类中。
2,尿素循环〔urea cycle〕:是一个由4步酶促反应组成的,能够今后自氨和天
冬氨酸的氮转化为尿素的循环。尿素循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代
谢循环。
3,脱氨〔deamination〕:在酶的催化下从生物分子〔氨基酸或核苷酸〕中除去
氨基的过程。
4,氧化脱氨〔oxidative deamination〕:α-氨基酸在酶的催化下脱氨生成相应的
α-酮酸的过程。氧化脱氨实际上包括氧化和脱氨两个步骤。〔脱氨和水解〕
5,转氨〔transamination〕:一个α-氨基酸的α-氨基借助转氨酶的催化作用转移
到一个α-酮酸的过程。
6,乒乓反应〔ping-pong reaction〕:在该反应中,酶结合一个底物并开释一个
产物,留下一个取代酶,然后该取代酶再结合第二个底物和开释出第二个产物,
最后酶复原到它的起始状态。
7,生糖氨基酸〔glucongenic amino acid〕:降解可生成作为糖异生前体的分子,
例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。
8,生酮氨基酸〔acetonegenic amino acid〕:降解可生成乙酰CoA或酮体的氨
基酸。
9,苯酮尿症〔phenylketonuria〕:是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引起苯丙氨酸堆
积的代谢遗传病。缺乏丙酮酸羟化酶,苯丙氨酸只能靠转氨生成苯丙酮酸,病
人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆积对神经有毒害,使智力发肓显现障碍。
10,尿黑酸症〔alcaptonuria〕:是酪氨酸代谢中缺乏尿黑酸酶引起的代谢遗传
病。这种病人的尿中含有尿黑酸,在碱性条件下暴露于氧气中,氧化并聚合为
类似于黑色素的物质,从而使尿呈黑色。
第十五章
1,核苷酸磷酸化酶〔nucloside phosphoryalse〕:能分解核苷生成含氮碱和戊糖
的磷酸酯的酶。
2,核苷水解酶〔nucloside hydrolase〕:能分解核苷生成含氮碱和戊糖的酶。
3,从头合成〔de novo synthesis〕:生物体内用简单的前体物质合成生物分子
的途径,例如核苷酸的从头合成。
4,补救途径〔salvage pathway〕:与从头合成途径不同,生物分子,例如核苷
酸,能够由该类分子降解形成的中间代谢物,如碱基等来合成,该途径是一个
再循环途径。
5,痛风(gout):是尿酸过量生产或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆积而造成的,
尿酸结晶堆积在软骨、软组织、肾脏以及关节处。在关节处的沉积会造成剧烈
的疼痛。
6,别嘌呤醇〔allopurinol〕:是结构上相似于黄嘌呤的化合物〔在嘌呤环上第七
位是C,第八位是N〕,对黄嘌呤氧化酶有专门强的抑制作用,常用来治疗痛风。
7,自杀抑制作用〔suicide substrate〕:底物类似物经酶催化生成的产物变成了
该酶的抑制剂,例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制就属于这种类型。
8,Lesch-Nyhan综合症〔Lesch-Nyhan syndrome〕:也称为自毁容貌症,是由
于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶的遗传缺陷引起的。缺乏该酶使得次黄嘌呤
和鸟嘌呤不能转换为IMP和GMP,而是降解为尿酸,过量尿酸将导致Lesch-
Nyhan综合症。
第十六章
1,激素〔hormones〕:一类由内分泌器官合成的微量的化学物质,它由血液运
输到靶组织起着信使的作用,调剂靶组织〔或器官〕的功能。
2,激素受体〔hormone receptor〕:位于细胞表面或细胞内,结合特异激素并引
发细胞响应的蛋白质。
3,第二信使〔second messenger〕:响应外部信号〔第一信使〕,例如激素,而
在细胞内合成的效应分子,例如cAMP,肌醇三磷酸或二酰基甘油等。第二信
使再去调剂靶酶,引起细胞内各种效应。
4,级联放大〔amplification cascade〕:在体内的不同部位,通过一系列酶的酶
促反应来传递一个信息,同时初始信息在传递到系列反应的最后时,信号得到
放大,如此的一个系列叫作级联系统。
5,G蛋白〔G protein〕:在细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋
白,由α、β、γ三个不同亚基组成。激素与激素受体结合诱导GTP跟G蛋白
结合的GDP进行交换,结果激活位于信号传导途径中下游的腺苷酸环化酶。G
蛋白将细胞外的第一信使肾上腺素等激素和细胞内的腺苷酸环化酶催化的腺
苷酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。G蛋白具有内源GTP酶活性。
6,激素效应元件〔HER〕:指类固醇甲状腺素等激素受体结合的一段短的DN
A序列〔12~20bp〕,这类受体结合DNA后可改变相邻基因的表达。
第十七章
1,半保留复制〔semiconservative replication〕:DNA复制的一种方式。每条链
都可用作合成互补链的模板,合成出两分子的双链DNA,每个分子差不多上由
一条亲代链和一条新合成的链组成。
2,复制叉〔replication fork〕:Y字型结构,在复制叉处作为模板的双链DNA
解旋,同是合成新的DNA链。
3,DNA聚合酶〔DNA polymerase〕:以DNA为模板,催化核苷酸残基加到已
存在的聚核苷酸3ˊ末端反应的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性,
可用来校正新合成的核苷酸的序列。
4,Klenow片段〔Klenow fragment〕: DNA聚合酶I经部分水解生成的
C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3
ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。
5,前导链〔leading strand〕:与复制叉移动的方向一致,通过连续的5ˊ-3ˊ聚合
合成新的DNA链。
6,滞后链〔lagging strand〕:与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5ˊ-3ˊ
聚合合成的新的DNA链。
7,冈崎片段〔Okazaki fragment〕:相对比较短的DNA链〔大约1000核苷酸
残基〕,是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段,这是Reiji Okazak
i在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观看到的。
8,引发体〔primosome〕:一种多蛋白复合体,中的引发体包括催化DN
A滞后链不连续DNA合成所必需的,短的RNA引物合成的引发酶,解旋酶。
9,复制体〔replisome〕:一种多蛋白复合体,包含DNA聚合酶、引发酶、解
旋酶、单链结合蛋白和其它辅助因子。复制体位于每个复制叉处,进行细菌染
色体DNA复制的聚合反应。
10,单链结合蛋白〔SSB〕:一种与单链DNA结合紧密的蛋白,它的结构能够
防止复制叉处单链DNA本身重新折叠回双链结构。
11,滚环复制〔rolling-circle replication〕:复制环状DNA的一种模式,在该模
式中,DNA聚合酶结合在一个缺口链的3ˊ端,绕环合成与模板链互补的DNA,
每一轮差不多上新合成的DNA取代前一轮合成的DNA。
12,逆转录酶〔reverse transcriptase〕:一种催化以RNA为模板合成DNA的D
NA聚合酶,具有RNA指导的DNA合成、水解RNA和DNA指导的DNA合
成的酶活性。
13,互补NDA〔cDNA〕:通过逆转录酶以mRNA为模板合成的双链DNA。
14,聚合酶链式反应〔PCR〕:扩增样品中的DNA量和富集众多DNA分子中
的一个特定的DNA序列的一种技术。在该反应中,使用与目的DNA序列互补
的寡核苷酸作为引物,进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性、引物退火
和在Taq DNA聚合酶催化下的DNA合成。
15,直截了当修复〔direct repair〕:是通过一种可连续扫描DNA,识别出损害
部位的蛋白质,将损害部位直截了当修复的方法。该修复方法不用切断DNA
或切除碱基。
16切除修复〔excision repair〕:通过切除-修复内切酶使DNA损害排除的修复
方法。一样是切除损害区,然后在DNA聚合酶的作用下,以露出的单链为模
板合成新的互补链,最后用连接酶将缺口连接起来。
17,错配修复〔mismatch repair〕:在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核
苷酸序列复原的修复方式。这种修复方式的过程是:识别出正确的链,切除掉
不正确链的部分,然后通过DNA聚合酶和DNA连接酶的作用,合成正确配对
的双链DNA。
第十八章
1,遗传学中心法那么〔genetic central dogma〕:描述从一个基因到相应蛋白质
的信息流的途径。遗传信息贮存在DNA中,DNA被复制传给子代细胞,信息
被拷贝或由DNA转录成mRNA,然后mRNA翻译成多肽或蛋白质。只是,由
于逆转录酶的反应,也能够以mRNA为模板合成DNA。
2,转录〔transcription〕:在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催
化下,从双链DNA分子中拷贝生物信息生成一条RNA链的过程。
3,模板链〔template strand〕:可作为模板转录为RNA的那条链,该链与转录
的RNA碱基互补〔A-U,G-C〕。在转录过程中,RNA聚合酶与模板链结合,并
沿着模板链的3´→5´方向移动,按照5´→3´方向催化RNA的合成。
4,编码链〔coding strand〕:双链DNA中,不能进行转录的那一条DNA链,
该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致〔在RNA中是以U取代了D
NA中的T〕。
5,核心酶〔core enzyme〕:大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成〔2α
2β,δ〕,没有δ基的酶叫核心酶。核心酶只能使已开始合成的RNA链延长,
但不具有起始合成RNA的能力,必须加入δ基才表现出全部聚合酶的活性。
6,RNA聚合酶〔RNA polymerase〕:以一条DNA链或RNA为模板催化由核
苷-5´-三磷酸合成RNA的酶。
7,启动子〔promoter〕:在DNA分子中,RNA聚合酶能够结合并导致转录起
始的序列。
8,内含子〔intron〕:在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷
酸序列。术语内含子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域。
9,外显子〔exon〕:既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子
中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。
10,终止因子〔termination factor〕:协助RNA聚合酶识别终止信号的的辅助
因子〔蛋白质〕。
11,核酶〔ribozyme〕:具有像酶那样催化功能的RNA分子。
12,剪接体〔spliceosome〕:大的蛋白质—RNA复合体,它催化内含子从mRN
A前体中除去的反应。
13,RNA加工过程〔RNA processing〕:将一个RNA原初转录产物转换成成熟
RNA分子的反应过程。加工包括从原初产物中删除一些核苷酸,添加一些基因
没有编码的核苷酸和对那些碱基进行共价修饰。
14,RNA剪接〔RNA splicing〕:从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去
内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。
第十九章
1,翻译〔translation〕:在蛋白质合成期间,将存在于mRNA上代表一个多肽
的核苷酸残基序列转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。
2,遗传密码〔genetic code〕:核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残
基序列之间的对应关系。;连续的3个核苷酸残基序列为一个密码子,特指一
个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码子组成的,几乎为所有生物通用。
3,起始密码子〔iniation codon〕:指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见
的起始密码子是蛋氨酸密码:AUG
4,终止密码子〔termination codon〕:任何tRNA分子都不能正常识别的,但
可被专门的蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上开释的密码子。存在三
个终止密码子:UAG ,UAA和UGA。
5,密码子〔condon〕:mRNA〔或DNA〕上的三联体核苷酸残基序列,该序列
编码着一个指定的氨基酸 ,tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。
6,反密码子〔anticodon〕:tRNA分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序
列。在翻译期间,反密码子与mRNA中的互补密码子结合。
7,简并密码子〔degenerate codon〕:也称为同义密码子。是指编码相同的氨基
酸的几个不同的密码子。
8,氨基酸臂〔amino arm〕:也称为接纳茎。tRNA分子中靠近3ˊ端的核苷酸序
列和5ˊ端的序列碱基配对,形成的可接收氨基酸的臂〔茎〕。
9,TψC臂〔TψC arm〕:tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶
核苷酸残基序列的茎-环结构。
10,氨酰-tRNA〔aminoacyl-tRNA〕:在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸残基共价连接
了氨基酸的tRNA分子。
11,同工tRNA〔isoacceptor tRNA〕:结合相同氨基酸的不同的tRNA分子。
12,摆动〔wobble〕:处于密码子3ˊ端的碱基与之互补的反密码子5ˊ端的碱基
〔也称为摆动位置〕,例如I能够与密码子上3ˊ端的U,C和A配对。由于存
在摆动现象,因此使得一个tRNA反密码子能够和一个以上的mRAN密码子结
合。
13,氨酰-tRNA合成酶〔aminoacyl-tRNA synthetase〕:催化特定氨基酸激活并
共介结合在相应的tRNA分子3ˊ端的酶。
14,翻译起始复合物〔translation initiation complex〕:由核糖体亚基,一个m
RNA模板,一个起始的tRNA分子和起始因子组成并组装在蛋白质合成起始点
的复合物。
15,读码框〔reading frame〕:代表一个氨基酸序列的mRNA分子的非重叠密
码序列。一个mRNA读码框是由转录起始位置〔通常是AUG密码〕确定的。
16,SD序列〔Shine-Dalgarno sequence〕:mRNA中用于结合原核生物核糖体
的序列。
17,肽酰转移酶〔peptidy transeferace〕:蛋白质合成期间负责转移肽酰基和催
化肽键形成的酶。
18,嘌吟毒素〔puromycin〕:通过整合到生长着的肽链,引起肽链合成提早终
止来抵制多肽链合成的一种抗生素。
19,开放读码框〔open reading frame〕:DNA或RNA序列中一段不含终止密
码子的连续的非重叠核苷酸密码。
20,信号肽〔signal peptide〕:常指新合成多肽链中用于指导蛋白质夸膜转移〔定
位〕的N-末端氨基酸序列〔有时不一定在N端〕。
第二十章
1,转录因子〔transcription factor〕:在转录起始复合物的组装过程中,与启动
子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质。某些转录因子在RNA延伸
时一直坚持着结合状态。
2,操纵子〔operon〕:是由一个或多个相关基因以及调控他们转录的操纵因子
启动子序列组成的基因表达单位。
3,操纵因子〔operator〕:与特定阻遏蛋白相互作用,调控一个基因或一组基因
表达的DNA区。
4,结构基因〔structural gene〕:编码一个蛋白质或一个RNA的基因序列。
5,转录激剂〔transcriptional activator〕:通过增加RNA聚合酶的活性来加快转
录速度的一种调剂DNA结合蛋白。
6,阻遏物〔repressor〕:与一个基因的调控序列或操纵基因结合以阻止该基因
转录的一类蛋白质。
7,衰减作用〔attenuation〕:一种翻译调控机制。在该机制中,核糖体沿着mR
NA分子的移动的速度决定转录是进行依旧终止。
8,亮氨酸拉链〔leucine zipper〕:显现地DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的
一种结构基元〔motif〕。当来自同一个或不同多肽链的两个两用性的α-螺旋的
疏水面〔常常含有亮氨酸残基〕相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形
成了亮氨酸拉链。
9,锌脂〔zinc fingre〕:也是一种常显现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。
是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2
个His配位的Zn
2
构成,形成的结构像手指状。
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