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2024年5月1日发(作者：submithandler需要type为submit吗)

NCBI在线Blast的图文说明

Blast（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中

进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST

结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。

BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。

Blast中常用的程序介绍：

1、BLASTP 是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每

条所查序列作一对一的序列比对。

2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核

酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。

3、BLASTN 是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序

列作一对一地核酸序列比对。

4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序

列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。

5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的

核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生

36种比对阵列。

NCBI的在线blast：/

1、进入在线blast界面，可以选择blast特定的物种（如人，小鼠，水稻等），也可

以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的

核酸库作为例子。

NCBI在线blast页面

2、粘贴fasta格式的序列。选择一个要比对的数据库。关于数据库的说明请看NCBI在

线blast数据库的简要说明。一般的话参数默认。


本文标签： 序列 核酸 蛋白

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